|
1.
|
|
34 p, 9.1 MB |
Targeting lymphoid-derived IL-17 signaling to delay skin aging
/
Solá, Paloma (Institute for Research in Biomedicine. Barcelona Institute of Science and Technology) ;
Mereu, Elisabetta (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Recerca contra la Leucèmia Josep Carreras) ;
Bonjoch, Júlia (Institute for Research in Biomedicine. Barcelona Institute of Science and Technology) ;
Casado Pelaez, Marta (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Recerca contra la Leucèmia Josep Carreras) ;
Prats, Neus (Institute for Research in Biomedicine. Barcelona Institute of Science and Technology) ;
Aguilera Pujabet, Mònica (Institute for Research in Biomedicine. Barcelona Institute of Science and Technology) ;
Reina, Oscar (Institute for Research in Biomedicine. Barcelona Institute of Science and Technology) ;
Blanco, Enrique (Centre for Genomic Regulation. Barcelona Institute of Science and Technology) ;
Esteller, Manel (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Recerca contra la Leucèmia Josep Carreras) ;
Di Croce, Luciano (Institució Catalana de Recerca i Estudis Avançats) ;
Heyn, Holger (Centre for Genomic Regulation. Barcelona Institute of Science and Technology) ;
Solanas, Guiomar (Institute for Research in Biomedicine. Barcelona Institute of Science and Technology) ;
Benitah, Salvador Aznar (Institució Catalana de Recerca i Estudis Avançats)
Skin aging is characterized by structural and functional changes that contribute to age-associated frailty. This probably depends on synergy between alterations in the local niche and stem cell-intrinsic changes, underscored by proinflammatory microenvironments that drive pleotropic changes. [...]
2023 -  10.1038/s43587-023-00431-z
Nature Aging, Vol. 3 Núm. 6 (june 2023) , p. 688-704
|
|
|
2.
|
|
18 p, 15.6 MB |
Macrophage and neutrophil heterogeneity at single-cell spatial resolution in human inflammatory bowel disease
/
Garrido-Trigo, Alba (Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer) ;
Corraliza, Ana Maria (Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer) ;
Veny, Marisol (Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer) ;
Dotti, Isabella (Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer) ;
Melón-Ardanaz, Elisa (Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer) ;
Rill, Aina (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Recerca contra la Leucèmia Josep Carreras) ;
Crowell, Helena L. (Department of Molecular Life Sciences. University of Zurich. Switzerland. SIB Swiss Institute of Bioinformatics) ;
Corbí, Ángel (Centro de Investigaciones Biológicas. Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC)) ;
Gudiño, Victoria (Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer) ;
Esteller, Miriam (Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer) ;
Álvarez-Teubel, Iris (Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer) ;
Aguilar, Daniel (Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer) ;
Masamunt, M.Carmen (Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer) ;
Killingbeck, E. (NanoString Technologies) ;
Kim, Youngmi (NanoString Technologies) ;
Leon, Michael (NanoString Technologies) ;
Visvanathan, Sudha (Translational Medicine and Clinical Pharmacology. Boehringer-Ingelheim Pharmaceuticals Inc) ;
Marchese, Domenica (Centre de Regulació Genòmica) ;
Caratù, Ginevra (Centre de Regulació Genòmica) ;
Martin Cardona, Albert (Hospital Universitari MútuaTerrassa (Terrassa, Catalunya)) ;
Esteve, Maria (Department of Gastroenterology. Hospital Universitari Mútua Terrassa. Universitat de Barcelona) ;
Panés, Julian (Centro de Investigación Biomédica en Red de Enfermedades Hepáticas y Digestivas) ;
Ricart, Elena (Centro de Investigación Biomédica en Red de Enfermedades Hepáticas y Digestivas) ;
Mereu, Elisabetta (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Recerca contra la Leucèmia Josep Carreras) ;
Heyn, Holger (Universitat Pompeu Fabra) ;
Salas, Azucena (Centro de Investigación Biomédica en Red de Enfermedades Hepáticas y Digestivas)
Ulcerative colitis and Crohn's disease are chronic inflammatory intestinal diseases with perplexing heterogeneity in disease manifestation and response to treatment. While the molecular basis for this heterogeneity remains uncharacterized, single-cell technologies allow us to explore the transcriptional states within tissues at an unprecedented resolution which could further understanding of these complex diseases. [...]
2023 - 10.1038/s41467-023-40156-6
Nature communications, Vol. 14 Núm. 1 (december 2023) , p. 4506
|
|
|
3.
|
|
28 p, 8.7 MB |
Glioblastoma cell fate is differentially regulated by the microenvironments of the tumor bulk and infiltrative margin
/
Garcia-Diaz, Claudia (Samantha Dickson Brain Cancer Unit) ;
Pöysti, Anni (Samantha Dickson Brain Cancer Unit) ;
Mereu, Elisabetta (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Recerca contra la Leucèmia Josep Carreras) ;
Clements, Melani P. (Samantha Dickson Brain Cancer Unit) ;
Brooks, Lucy J. (Samantha Dickson Brain Cancer Unit. UCL Cancer Institute) ;
Galvez-Cancino, Felipe (Cancer Immunology Unit. Research Department of Haematology) ;
Castillo, Simon P. (The Institute of Cancer Research) ;
Tang, Wenhao T. (Department of Mathematics. Imperial College London) ;
Beattie, Gordo (University College London) ;
Courtot, Lilas (Samantha Dickson Brain Cancer Unit) ;
Ruiz, Sara (Barcelona Institute of Science and Technology (BIST)) ;
Roncaroli, Federico (University of Manchester) ;
Yuan, Yinyin (The Institute of Cancer Research) ;
Marguerat, Samuel (University College London) ;
Quezada, Sergio A. (UCL Cancer Institute) ;
Heyn, Holger (Universitat Pompeu Fabra) ;
Parrinello, Simona (UCL Cancer Institute)
Glioblastoma (GBM) recurrence originates from invasive margin cells that escape surgical debulking, but to what extent these cells resemble their bulk counterparts remains unclear. Here, we generated three immunocompetent somatic GBM mouse models, driven by subtype-associated mutations, to compare matched bulk and margin cells. [...]
2023 - 10.1016/j.celrep.2023.112472
Cell reports, Vol. 42 Núm. 5 (30 2023) , p. 112472
|
|
|
4.
|
|
30 p, 7.3 MB |
Single-Cell Multiomics Analysis of Myelodysplastic Syndromes and Clinical Response to Hypomethylating Therapy
/
Campillo-Marcos, Ignacio (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Recerca contra la Leucèmia Josep Carreras) ;
Casado Pelaez, Marta (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Recerca contra la Leucèmia Josep Carreras) ;
Davalos, Veronica (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Recerca contra la Leucèmia Josep Carreras) ;
Ferrer, Gerardo (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Recerca contra la Leucèmia Josep Carreras) ;
Mata, Caterina (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Recerca contra la Leucèmia Josep Carreras) ;
Mereu, Elisabetta (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Recerca contra la Leucèmia Josep Carreras) ;
Roué, Gaël (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Recerca contra la Leucèmia Josep Carreras) ;
Valcárcel, David (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Molero, Antonieta (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Zamora, Lurdes (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ;
Xicoy, Blanca (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ;
Palomo Sanchís, Laura (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Recerca contra la Leucèmia Josep Carreras) ;
Acha, Pamela (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Recerca contra la Leucèmia Josep Carreras) ;
Manzanares Mileo, Ana (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Recerca contra la Leucèmia Josep Carreras) ;
Tobiasson, Magnus (Karolinska Institutet (Estocolm, Suècia)) ;
Hellström-Lindberg, Eva (Karolinska Institutet (Estocolm, Suècia)) ;
Sole, F (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Recerca contra la Leucèmia Josep Carreras) ;
Esteller, M (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Recerca contra la Leucèmia Josep Carreras)
Alterations in epigenetic marks, such as DNA methylation, represent a hallmark of cancer that has been successfully exploited for therapy in myeloid malignancies. Hypomethylating agents (HMAs), such as azacitidine (AZA), have become standard-of-care therapy to treat myelodysplastic syndromes (MDS), myeloid neoplasms that can evolve into acute myeloid leukemia (AML). [...]
2024 - 10.1158/2767-9764.CRC-23-0389
Cancer Research Communications, Vol. 4 Núm. 2 (2024)
|
|
|
5.
|
|
16 p, 4.9 MB |
Cohesin couples transcriptional bursting probabilities of inducible enhancers and promoters
/
Robles-Rebollo, Irene (Imperial College London) ;
Cuartero, Sergi (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Recerca contra la Leucèmia Josep Carreras) ;
Canellas-Socias, Adrià (Institut de Recerca Biomèdica) ;
Wells, Sarah (Imperial College London) ;
Karimi, Mohammad M (King's College London) ;
Mereu, Elisabetta (Institut de Ciència i Tecnologia de Barcelona. Institut de Recerca en Biomedicina) ;
Chivu, Alexandra G (Cornell University) ;
Heyn, Holger (Institut de Ciència i Tecnologia de Barcelona. Institut de Recerca en Biomedicina) ;
Whilding, Chad (Imperial College London) ;
Dormann, Dirk (Imperial College London) ;
Marguerat, Samuel (Imperial College London) ;
Rioja, Inmaculada (GlaxoSmithKline Medicines Research Centre (Regne Unit)) ;
Prinjha, Rab K (GlaxoSmithKline Medicines Research Centre (Regen Unit)) ;
Stumpf, Michael P H (University of Melbourne) ;
Fisher, Amanda G (Imperial College London) ;
Merkenschlager, Mattihas (Imperial College London) ;
Universitat Autònoma de Barcelona
Innate immune responses rely on inducible gene expression programmes which, in contrast to steady-state transcription, are highly dependent on cohesin. Here we address transcriptional parameters underlying this cohesin-dependence by single-molecule RNA-FISH and single-cell RNA-sequencing. [...]
2022 - 10.1038/s41467-022-31192-9
Nature communications, Vol. 13 Núm. 1 (december 2022) , p. 4342
|
|
|
6.
|
|
15 p, 19.7 MB |
A single-cell tumor immune atlas for precision oncology
/
Nieto, Paula (Centre de Regulació Genòmica) ;
Elosua-Bayes, Marc (Centre de Regulació Genòmica) ;
Trincado Alonso, Juan Luis, 1987- (Centre de Regulació Genòmica) ;
Marchese, Domenica (Centre de Regulació Genòmica) ;
Massoni-Badosa, Ramon (Centre de Regulació Genòmica) ;
Salvany, Maria (Institut Recerca Biomèdica de Barcelona) ;
Henriques, Ana (Institut Recerca Biomèdica de Barcelona) ;
Nieto Sáchica, Juan Camilo (Centre de Regulació Genòmica) ;
Aguilar-Fernández, Sergio (Centre de Regulació Genòmica) ;
Mereu, Elisabetta (Centre de Regulació Genòmica) ;
Moutinho, Catia (Centre de Regulació Genòmica) ;
Ruiz, Sara (Centre de Regulació Genòmica) ;
Lorden, Patricia (Centre de Regulació Genòmica) ;
Chin, Vanessa T. (St. Vincent Hospital Sydney) ;
Kaczorowski, Dominik (Garvan Institute of Medical Research (Darlinghurst, Austràlia)) ;
Chan, Chia Ling (Garvan Institute of Medical Research (Darlinghurst, Austràlia)) ;
Gallagher, Richard (University of Notre Dame) ;
Chou, Angela (University of Sydney) ;
Planas-Rigol, Ester (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Rubio-Perez, Carlota (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Gut, Ivo (Centre de Regulació Genòmica) ;
Piulats, Josep M. (Institut Català d'Oncologia) ;
Seoane Suárez, Joan (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular) ;
Powell, Joseph E. (University of New South Wales) ;
Batlle, Eduard (Centro de Investigación Biomédica en Red de Cáncer) ;
Heyn, Holger (Universitat Pompeu Fabra)
2021 - 10.1101/gr.273300.120
Genome research, Vol. 31 Núm. 10 (october 2021) , p. 1913-1926
|
|
|
7.
|
|
15 p, 4.2 MB |
GATA2 Promotes Hematopoietic Development and Represses Cardiac Differentiation of Human Mesoderm
/
Castaño Cardoso, Julio (Centro de Investigación Biomédica en Red de Bioingeniería, Biomateriales y Nanomedicina) ;
Aranda, Sergi (Universitat Pompeu Fabra. Centre de Regulació Genòmica (CRG-UPF)) ;
Bueno, Clara (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Recerca contra la Leucèmia Josep Carreras) ;
Calero-Nieto, Fernando (Department of Hematology. Wellcome and MRC Cambridge Stem Cell Institute and Cambridge Institute for Medical Research. University of Cambridge) ;
Mejia-Ramirez, Eva (Centro de Medicina Regenerativa de Barcelona) ;
Mosquera, José Luis (Institut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge) ;
Blanco, Enrique (Universitat Pompeu Fabra. Centre de Regulació Genòmica (CRG-UPF)) ;
Wang, Xiaonan (Wellcome and MRC Cambridge Stem Cell Institute and Cambridge Institute for Medical Research. University of Cambridge) ;
Prieto, Cristina (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Recerca contra la Leucèmia Josep Carreras) ;
Zabaleta, Lorea (Laboratory of Hematological Diseases. Fundación Inbiomed) ;
Mereu, Elisabetta (Centre de Regulació Genòmica) ;
Rovira, Meritxell (Centro de Medicina Regenerativa de Barcelona) ;
Jiménez-Delgado, Senda (Centro de Medicina Regenerativa de Barcelona) ;
Matson, Daniel Rusch (Department of Cell and Regenerative Biology. UW-Madison Blood Research Program. Carbone Cancer Center. University of Wisconsin School of Medicine and Public Health) ;
Heyn, Holger (Universitat Pompeu Fabra) ;
Bresnick, Emery H. (Department of Cell and Regenerative Biology. UW-Madison Blood Research Program. Carbone Cancer Center. University of Wisconsin School of Medicine and Public Health) ;
Göttgens, Berthold (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Recerca contra la Leucèmia Josep Carreras) ;
Di Croce, Luciano (Institució Catalana de Recerca i Estudis Avançats) ;
Menéndez Bujan, Pablo (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Recerca contra la Leucèmia Josep Carreras) ;
Raya, Ángel (Institució Catalana de Recerca i Estudis Avançats) ;
Giorgetti, Alessandra (Centro de Medicina Regenerativa de Barcelona) ;
Universitat Autònoma de Barcelona
In vertebrates, GATA2 is a master regulator of hematopoiesis and is expressed throughout embryo development and in adult life. Although the essential role of GATA2 in mouse hematopoiesis is well established, its involvement during early human hematopoietic development is not clear. [...]
2019 - 10.1016/j.stemcr.2019.07.009
Stem cell reports, Vol. 13 Núm. 3 (october 2019) , p. 515-529
|
|
|
8.
|
|
41 p, 7.4 MB |
Immune Cell Associations with Cancer Risk
/
Palomero, Luis (Institut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge) ;
Galván-Femenía, Iván (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ;
de Cid, Rafael (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ;
Espín, Roderic (Institut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge) ;
Barnes, Daniel R. (University of Cambridge) ;
Blommaert, Eline (Institut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge) ;
Gil-Gil, Miguel (Institut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge) ;
Falo, Catalina (Institut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge) ;
Stradella, Agostina (Institut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge) ;
Ouchi, Dan (Universitat Autònoma de Barcelona) ;
Roso-Llorach, Albert (Institut Universitari d'Investigació en Atenció Primària Jordi Gol) ;
Violán, Concepció (Institut Universitari d'Investigació en Atenció Primària Jordi Gol) ;
Peña-Chilet, María (Hospital Universitario Virgen del Rocío (Sevilla, Andalusia)) ;
Dopazo, Joaquín (Hospital Universitario Virgen del Rocío (Sevilla, Andalusia)) ;
Extremera, Ana Isabel (Institut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge) ;
García-Valero, Mar (Institut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge) ;
Herranz-Ors, C.. (Institut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge) ;
Mateo, Francesca (Institut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge) ;
Mereu, Elisabetta (Centre Nacional d'Anàlisi Genòmica) ;
Beesley, Jonathan (QIMR Berghofer Medical Research Institute (Brisbane, Austràlia)) ;
Chenevix-Trench, Georgia (QIMR Berghofer Medical Research Institute (Brisbane, Austràlia)) ;
Roux, Cecilia (University Health Network) ;
Mak, Tak (University Health Network) ;
Brunet, Joan (Institut d'Investigació Biomèdica de Girona) ;
Hakem, Razq (University of Toronto) ;
Gorrini, Chiara (University Health Network (Toronto, Canadà)) ;
Antoniou, Antonis C. (University of Cambridge) ;
Lázaro, Conxi (Institut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge) ;
Pujana, Miquel Angel (Institut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge) ;
Centre for Cancer Genetic Epidemiology.
CIMBA ;
Universitat Autònoma de Barcelona
Proper immune system function hinders cancer development, but little is known about whether genetic variants linked to cancer risk alter immune cells. Here, we report 57 cancer risk loci associated with differences in immune and/or stromal cell contents in the corresponding tissue. [...]
2020 - 10.1016/j.isci.2020.101296
iScience, Vol. 23 (june 2020)
|
|
|
9.
|
|
7 p, 740.6 KB |
Dual MET and ERBB inhibition overcomes intratumor plasticity in osimertinib-resistant-advanced non-small-cell lung cancer (NSCLC)
/
Martinez-Marti, Alex (Universitat Autònoma de Barcelona) ;
Felip, Enriqueta (Universitat Autònoma de Barcelona) ;
Matito, Judit (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Mereu, Elisabetta (Universitat Pompeu Fabra) ;
Navarro, Alejandro (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Cedrés, Susana (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Pardo Aranda, Nuria (Universitat Autònoma de Barcelona) ;
Martinez de Castro, Ana (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Remon, Jordin (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Miquel, J. M. (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Guillaumet-Adkins, A. (Universitat Pompeu Fabra) ;
Nadal, Ernest (Institut Català d'Oncologia) ;
Rodriguez Esteban, Gustavo (Universitat Pompeu Fabra) ;
Arqués, O. (Stem Cells and Cancer Group) ;
Fasani, R. (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Nuciforo, Paolo (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Heyn, Holger (Universitat Pompeu Fabra) ;
Villanueva Garatachea, Alberto (Institut Català d'Oncologia) ;
Palmer, Héctor G (Stem Cells and Cancer Group) ;
Vivancos, Ana (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia)
Third-generation epidermal growth factor receptor tyrosine kinase inhibitors (EGFR-TKIs) such as osimertinib are the last line of targeted treatment of metastatic non-small-cell lung cancer (NSCLC) EGFR -mutant harboring T790M. [...]
2017 - 10.1093/annonc/mdx396
Annals of oncology, Vol. 28 (july 2017) , p. 2451-2457
|
|
|
10.
|
|
15 p, 3.0 MB |
Single-cell transcriptome conservation in cryopreserved cells and tissues
/
Guillaumet-Adkins, Amy (Centre de Regulació Genòmica) ;
Rodríguez-Esteban, Gustavo (Centre de Regulació Genòmica) ;
Mereu, Elisabetta (Centre de Regulació Genòmica) ;
Mendez-Lago, Maria (Centre de Regulació Genòmica) ;
Jaitin, Diego A. (Weizmann Institute of Science (Israel). Department of Immunology) ;
Villanueva, Alberto (Hospital Universitari de Bellvitge) ;
Vidal, August (Institut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge) ;
Martinez-Marti, Alex (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Medicina) ;
Felip, Enriqueta (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Medicina) ;
Vivancos, Ana (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Keren-Shaul, Hadas (Weizmann Institute of Science (Israel). Department of Immunology) ;
Heath, Simon (Centre de Regulació Genòmica) ;
Gut, Marta (Centre de Regulació Genòmica) ;
Amit, Ido (Weizmann Institute of Science (Israel). Department of Immunology) ;
Gut, Ivo (Centre de Regulació Genòmica) ;
Heyn, Holger (Centre de Regulació Genòmica)
A variety of single-cell RNA preparation procedures have been described. So far, protocols require fresh material, which hinders complex study designs. We describe a sample preservation method that maintains transcripts in viable single cells, allowing one to disconnect time and place of sampling from subsequent processing steps. [...]
2017 - 10.1186/s13059-017-1171-9
Genome biology, Vol. 18 (march 2017)
|
|
visitante ::
identificación
alerta personal vía correo electrónico o subscríbase al 
canal RSS.
