Droplet Digital PCR Detects Low-Density Infection in a Significant Proportion of Helicobacter Pylori -Negative Gastric Biopsies of Dyspeptic Patients
Ramírez-Lázaro, María José (Parc Taulí Hospital Universitari. Institut d'Investigació i Innovació Parc Taulí (I3PT))
Lario, Sergio (Parc Taulí Hospital Universitari. Institut d'Investigació i Innovació Parc Taulí (I3PT))
Quílez, María Elisa (Parc Taulí Hospital Universitari. Institut d'Investigació i Innovació Parc Taulí (I3PT))
Montserrat, Antònia (Parc Taulí Hospital Universitari. Institut d'Investigació i Innovació Parc Taulí (I3PT))
Bella-Cueto, Maria Rosa (Parc Taulí Hospital Universitari. Institut d'Investigació i Innovació Parc Taulí (I3PT))
Junquera Flórez, Félix (Parc Taulí Hospital Universitari. Institut d'Investigació i Innovació Parc Taulí (I3PT))
García-Martínez, Lorena (Parc Taulí Hospital Universitari. Institut d'Investigació i Innovació Parc Taulí (I3PT))
Casalots, Alex (Parc Taulí Hospital Universitari. Institut d'Investigació i Innovació Parc Taulí (I3PT))
Parra, Tamara (Parc Taulí Hospital Universitari. Institut d'Investigació i Innovació Parc Taulí (I3PT))
Calvet Calvo, Xavier (Parc Taulí Hospital Universitari. Institut d'Investigació i Innovació Parc Taulí (I3PT))
Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Medicina

Data:	2020
Resum:	Dyspeptic patients (n = 236) were tested for H. pylori by histology, urea breath test, and rapid urease test. Patients were classified as having 3 positive (n = 25, control group), 2 positive (n = 12), one positive (n = 41), or zero positive (n = 158) diagnostic tests. DNA was extracted from gastric biopsies. Triplicate ddPCR testing for each of the 16S rDNA, ureA, and vacA(s) genes was performed using a QX200 ddPCR system (Bio-Rad). A gene was considered positive when detected by at least 2 of 3 repeated ddPCRs. H. pylori positivity was defined as having 2 or more positive genes. All the biopsies of the control patients were positive for all 3 16S rDNA, ureA, and vacA(s) genes. H. pylori infection was detected in 57 (36%), 22 (54%), and 9 (75%) patients with zero, 1, and 2 positive diagnostic tests, respectively. The density of infection was 5, 121, 599, and 3,133 copies of H. pylori genome equivalents for patients with zero, 1, and 2 of 3 positive test results and for the control group, respectively. ddPCR detected low-density "occult" H. pylori infection in a significant proportion (36%) of patients diagnosed as negative by conventional methods. The number of conventional positive tests was related to the density of infection.
Ajuts:	Instituto de Salud Carlos III PI14-00464
Drets:	Aquest document està subjecte a una llicència d'ús Creative Commons. Es permet la reproducció total o parcial, la distribució, i la comunicació pública de l'obra, sempre que no sigui amb finalitats comercials, i sempre que es reconegui l'autoria de l'obra original. No es permet la creació d'obres derivades.
Llengua:	Anglès
Document:	Article ; recerca ; Versió publicada
Publicat a:	Clinical and Translational Gastroenterology, Vol. 11 (june 2020) , ISSN 2155-384X

DOI: 10.14309/ctg.0000000000000184
PMID: 32568476

7 p, 464.4 KB

El registre apareix a les col·leccions:
Documents de recerca > Documents dels grups de recerca de la UAB > Centres i grups de recerca (producció científica) > Ciències de la salut i biociències > Institut d’Investigació i Innovació Parc Taulí (I3PT)
Articles > Articles de recerca
Articles > Articles publicats