Molecular profiling of long-term responders to immune checkpoint inhibitors in advanced non-small cell lung cancer
Frigola Rissech, Joan (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia)
Navarro, Alejandro (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia)
Carbonell, Caterina (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia)
Callejo, Ana (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia)
Iranzo, Patricia (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia)
Cedrés, Susana (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia)
Martinez-Marti, Alex (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia)
Pardo Aranda, Nuria (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia)
Saoudi-Gonzalez, Nadia (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia)
Martinez, Débora (Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer)
Jiménez, José (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia)
Sansano, Irene (Hospital Universitari Vall d'Hebron)
Mancuso, Francesco M. (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia)
Nuciforo, Paolo (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia)
Montuenga, Luis M. (Instituto de Investigación Sanitaria de Navarra)
Sanchez-Cespedes, Montse (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Recerca contra la Leucèmia Josep Carreras)
Prat, Aleix (Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer)
Vivancos, Ana (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia)
Felip, Enriqueta (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia)
Amat, Ramon (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia)
Universitat Autònoma de Barcelona

Data:	2020
Resum:	Immunotherapy has transformed advanced non-small cell lung cancer (NSCLC) treatment strategies and has led to unprecedented long-lasting responses in some patients. However, the molecular determinants driving these long-term responses remain elusive. To address this issue, we performed an integrative analysis of genomic and transcriptomic features of long-term immune checkpoint inhibitors (ICIs)-associated responders. We assembled a cohort of 47 patients with NSCLC receiving ICIs that was enriched in long-term responders [>18 months of progression-free survival (PFS)]. We performed whole-exome sequencing from tumor samples, estimated the tumor mutational burden (TMB), and inferred the somatic copy number alterations (SCNAs). We also obtained gene transcription data for a subset of patients using Nanostring, which we used to assess the tumor immune infiltration status and PD-L1 expression. Our results indicate that there is an association between TMB and benefit to ICIs, which is driven by those patients with long-term response. Additionally, high SCNAs burden is associated with poor response and negatively correlates with the presence of several immune cell types (B cells, natural killers, regulatory T cells or effector CD8 T cells). Also, CD274 (PD-L1) expression is increased in patients with benefit, mainly in those with long-term response. In our cohort, combined assessment of TMB and SCNAs burden enabled identification of long-term responders (considering PFS and overall survival). Notably, the association between TMB, SCNAs burden, and PD-L1 expression with the outcomes of ICIs treatment was validated in two public datasets of ICI-treated patients with NSCLC. Thus, our data indicate that TMB is associated with long-term benefit following ICIs treatment in NSCLC and that TMB, SCNAs burden, and PD-L1 are complementary determinants of response to ICIs.
Ajuts:	Agència de Gestió d'Ajuts Universitaris i de Recerca 2017-SGR-1738 Instituto de Salud Carlos III PI17-00938
Nota:	Altres ajuts: This work was supported by the Fundacion Cientifica Asociación Española Contra el Cancer-AECC [grant number GCB14142170 to LMM, MS-C, and EF].
Drets:	Aquest document està subjecte a una llicència d'ús Creative Commons. Es permet la reproducció total o parcial, la distribució, la comunicació pública de l'obra i la creació d'obres derivades, fins i tot amb finalitats comercials, sempre i quan es reconegui l'autoria de l'obra original.
Llengua:	Anglès
Document:	Article ; recerca ; Versió publicada
Matèria:	NSCLC ; PD-L1 ; Chromosomal alterations burden ; Copy number alterations ; Immune checkpoint inhibitors ; Long-term benefit ; Tumor mutational burden
Publicat a:	Molecular Oncology, 2020 , ISSN 1878-0261

DOI: 10.1002/1878-0261.12891
PMID: 33342055

14 p, 572.1 KB

El registre apareix a les col·leccions:
Documents de recerca > Documents dels grups de recerca de la UAB > Centres i grups de recerca (producció científica) > Ciències de la salut i biociències > Institut d'Investigació en Ciencies de la Salut Germans Trias i Pujol (IGTP) > Institut de Recerca contra la Leucèmia Josep Carreras
Articles > Articles de recerca
Articles > Articles publicats