Cross-sectional study of human coding- and non-coding RNAs in progressive stages of Helicobacter pylori infection
Lario Garcia, Sergio (Parc Taulí Hospital Universitari. Institut d'Investigació i Innovació Parc Taulí (I3PT))
Ramírez-Lázaro, María José (Parc Taulí Hospital Universitari. Institut d'Investigació i Innovació Parc Taulí (I3PT))
González-Lahera, Aintzane (Capresa, prevención de riesgos laborales (Barcelona, Catalunya))
Lavin, Jose L. (Capresa, prevención de riesgos laborales (Barcelona, Catalunya))
Vila-Casadesús, Maria (Centro de Investigación Biomédica en Red de Enfermedades Hepáticas y Digestivas)
Quílez Tierno, María Elisa (Parc Taulí Hospital Universitari. Institut d'Investigació i Innovació Parc Taulí (I3PT))
Brunet Vega, Anna (Parc Taulí Hospital Universitari. Institut d'Investigació i Innovació Parc Taulí (I3PT))
Lozano, Juan José (Centro de Investigación Biomédica en Red de Enfermedades Hepáticas y Digestivas)
Aransay, Ana M. (Capresa, prevención de riesgos laborales (Barcelona, Catalunya))
Calvet, Xavier (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Medicina)

Date:	2020
Abstract:	Helicobacter pylori infects 4. 4 billion individuals worldwide and is considered the most important etiologic agent for peptic ulcers and gastric cancer. Individual response to H. pylori infection is complex and depends on complex interactions between host and environmental factors. The pathway towards gastric cancer is a sequence of events known as Correa's model of gastric carcinogenesis, a stepwise inflammatory process from normal mucosa to chronic-active gastritis, atrophy, metaplasia and gastric adenocarcinoma. This study examines gastric clinical specimens representing different steps of the Correa pathway with the aim of identifying the expression profiles of coding- and non-coding RNAs that may have a role in Correa's model of gastric carcinogenesis. We screened for differentially expressed genes in gastric biopsies by employing RNAseq, microarrays and qRT-PCR. Here we provide a detailed description of the experiments, methods and results generated. The datasets may help other scientists and clinicians to find new clues to the pathogenesis of H. pylori and the mechanisms of progression of the infection to more severe gastric diseases. Data is available via ArrayExpress. Machine-accessible metadata file describing the reported data: 10. 6084/m9. figshare. 12349334.
Grants:	Instituto de Salud Carlos III PI12/01802
Rights:	Aquest document està subjecte a una llicència d'ús Creative Commons. Es permet la reproducció total o parcial, la distribució, la comunicació pública de l'obra i la creació d'obres derivades, fins i tot amb finalitats comercials, sempre i quan es reconegui l'autoria de l'obra original.
Language:	Anglès
Document:	Article ; recerca ; Versió publicada
Subject:	Infection ; Pathogens ; Diagnostic markers ; Transcriptomics
Published in:	Scientific data, Vol. 7 (september 2020) , ISSN 2052-4463

DOI: 10.1038/s41597-020-00636-6
PMID: 32901043

9 p, 3.4 MB

The record appears in these collections:
Research literature > UAB research groups literature > Research Centres and Groups (research output) > Health sciences and biosciences > Parc Taulí Research and Innovation Institute (I3PT
Articles > Research articles
Articles > Published articles