High Performance of a Dominant/X-Linked Gene Panel in Patients with Neurodevelopmental Disorders
Spataro, Nino (Parc Taulí Hospital Universitari. Institut d'Investigació i Innovació Parc Taulí (I3PT))
Trujillo-Quintero, Juan Pablo (Parc Taulí Hospital Universitari. Institut d'Investigació i Innovació Parc Taulí (I3PT))
Manso-Bazús, Carmen (Parc Taulí Hospital Universitari. Institut d'Investigació i Innovació Parc Taulí (I3PT))
Gabau, Elisabeth (Parc Taulí Hospital Universitari. Institut d'Investigació i Innovació Parc Taulí (I3PT))
Capdevila, Núria (Parc Taulí Hospital Universitari. Institut d'Investigació i Innovació Parc Taulí (I3PT))
Martinez-Glez, Víctor (Parc Taulí Hospital Universitari. Institut d'Investigació i Innovació Parc Taulí (I3PT))
Berenguer-Llergo, Antoni (Parc Taulí Hospital Universitari. Institut d'Investigació i Innovació Parc Taulí (I3PT))
Reyes, Sara (Parc Taulí Hospital Universitari. Institut d'Investigació i Innovació Parc Taulí (I3PT))
Brunet Vega, Anna (Parc Taulí Hospital Universitari. Institut d'Investigació i Innovació Parc Taulí (I3PT))
Baena Díez, Neus (Parc Taulí Hospital Universitari. Institut d'Investigació i Innovació Parc Taulí (I3PT))
Guitart, Míriam (Parc Taulí Hospital Universitari. Institut d'Investigació i Innovació Parc Taulí (I3PT))
Ruiz, Anna (Parc Taulí Hospital Universitari. Institut d'Investigació i Innovació Parc Taulí (I3PT))
Universitat Autònoma de Barcelona

Date:	2023
Abstract:	Neurodevelopmental disorders (NDDs) affect 2-5% of the population and approximately 50% of cases are due to genetic factors. Since de novo pathogenic variants account for the majority of cases, a gene panel including 460 dominant and X-linked genes was designed and applied to 398 patients affected by intellectual disability (ID)/global developmental delay (GDD) and/or autism (ASD). Pathogenic variants were identified in 83 different genes showing the high genetic heterogeneity of NDDs. A molecular diagnosis was established in 28. 6% of patients after high-depth sequencing and stringent variant filtering. Compared to other available gene panel solutions for NDD molecular diagnosis, our panel has a higher diagnostic yield for both ID/GDD and ASD. As reported previously, a significantly higher diagnostic yield was observed: (i) in patients affected by ID/GDD compared to those affected only by ASD, and (ii) in females despite the higher proportion of males among our patients. No differences in diagnostic rates were found between patients affected by different levels of ID severity. Interestingly, patients harboring pathogenic variants presented different phenotypic features, suggesting that deep phenotypic profiling may help in predicting the presence of a pathogenic variant. Despite the high performance of our panel, whole exome-sequencing (WES) approaches may represent a more robust solution. For this reason, we propose the list of genes included in our customized gene panel and the variant filtering procedure presented here as a first-tier approach for the molecular diagnosis of NDDs in WES studies.
Grants:	Instituto de Salud Carlos III PI19/01902
Rights:	Aquest document està subjecte a una llicència d'ús Creative Commons. Es permet la reproducció total o parcial, la distribució, la comunicació pública de l'obra i la creació d'obres derivades, fins i tot amb finalitats comercials, sempre i quan es reconegui l'autoria de l'obra original.
Language:	Anglès
Document:	Article ; recerca ; Versió publicada
Subject:	Autism ; Gene panel ; Intellectual disability ; Neurodevelopmental disorders ; Next generation sequencing ; Re-analysis
Published in:	Genes, Vol. 14 (march 2023) , ISSN 2073-4425

DOI: 10.3390/genes14030708
PMID: 36980980

13 p, 876.0 KB

The record appears in these collections:
Research literature > UAB research groups literature > Research Centres and Groups (research output) > Health sciences and biosciences > Parc Taulí Research and Innovation Institute (I3PT
Articles > Research articles
Articles > Published articles