Genomic analysis of Staphylococcus aureus isolates from bacteremia reveals genetic features associated with the COVID-19 pandemic
Sánchez Osuna, Miquel (Parc Taulí Hospital Universitari. Institut d'Investigació i Innovació Parc Taulí (I3PT))
Pedrosa, Marc (Parc Taulí Hospital Universitari. Institut d'Investigació i Innovació Parc Taulí (I3PT))
Bierge, Paula (Parc Taulí Hospital Universitari. Institut d'Investigació i Innovació Parc Taulí (I3PT))
Gómez Sánchez, Inmaculada (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí")
Alguacil Guillen, Marina (Parc Taulí Hospital Universitari. Institut d'Investigació i Innovació Parc Taulí (I3PT))
Espasa, Mateu (Parc Taulí Hospital Universitari. Institut d'Investigació i Innovació Parc Taulí (I3PT))
Erill, Ivan (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Enginyeria de la Informació i de les Comunicacions)
Gasch Blasi, Oriol (Parc Taulí Hospital Universitari. Institut d'Investigació i Innovació Parc Taulí (I3PT))
Quijada Pich, Oscar (Parc Taulí Hospital Universitari. Institut d'Investigació i Innovació Parc Taulí (I3PT))

Date:	2024
Abstract:	Genomic analyses of bacterial isolates are effective to compare the prevalence of antibiotic resistance genes and virulence determinants in different contexts. This study provides a comprehensive genomic description of 339 Staphylococcus aureus strains isolated from patients with bacteremia (2014-2022). Nosocomial acquisition accounted for 56. 6% of cases, with vascular catheters being the main infection source (31. 8%). Fatality (27. 4%), persistent bacteremia (19. 5%), and septic emboli (24. 2%) were documented. During the COVID-19 pandemic, S. aureus bacteremia episodes increased by 140%. Genetic features in pandemic isolates revealed higher prevalence of methicillin (mecA) and macrolide (msrA and mphC) resistance genes. Additionally, genes encoding clumping factors A and B, involved in fibrinogen binding, were more prevalent. This was linked to extensive macrolide use in COVID-19 accessory therapy and elevated fibrinogen levels in SARS-CoV-2 infection. These findings highlight S. aureus adaptation to COVID-19 selective pressures and the value of whole-genome sequencing in molecular epidemiology studies.
Grants:	Instituto de Salud Carlos III PI19/01911
Rights:	Aquest document està subjecte a una llicència d'ús Creative Commons. Es permet la reproducció total o parcial, la distribució, la comunicació pública de l'obra i la creació d'obres derivades, sempre que no sigui amb finalitats comercials, i sempre que es reconegui l'autoria de l'obra original.
Language:	Anglès
Document:	Article ; recerca ; Versió publicada
Subject:	Evolutionary mechanisms ; Genomic analysis ; Microbial genomics
Published in:	iScience, Vol. 27 Núm. 8 (16 2024) , p. 110402, ISSN 2589-0042

DOI: 10.1016/j.isci.2024.110402
PMID: 39108736

15 p, 3.5 MB

The record appears in these collections:
Research literature > UAB research groups literature > Research Centres and Groups (research output) > Health sciences and biosciences > Parc Taulí Research and Innovation Institute (I3PT
Research literature > UAB research groups literature > Research Centres and Groups (research output) > Health sciences and biosciences > Institut de Biotecnologia i de Biomedicina (IBB)
Articles > Research articles
Articles > Published articles