guest ::
| Home > Articles > Published articles > p53 rapidly restructures 3D chromatin organization to trigger a transcriptional response |
| Home > Articles > Published articles > p53 rapidly restructures 3D chromatin organization to trigger a transcriptional response |
(Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Recerca contra la Leucèmia Josep Carreras) (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Recerca contra la Leucèmia Josep Carreras) (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Recerca contra la Leucèmia Josep Carreras) (Barcelona Supercomputing Center) (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Recerca contra la Leucèmia Josep Carreras) (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Recerca contra la Leucèmia Josep Carreras) (University College London) (Florida State University) (Centro de Investigación Biomédica en Red de Cáncer) (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Recerca contra la Leucèmia Josep Carreras) (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Recerca contra la Leucèmia Josep Carreras)
| Date: | 2024 |
| Abstract: | Activation of the p53 tumor suppressor triggers a transcriptional program to control cellular response to stress. However, the molecular mechanisms by which p53 controls gene transcription are not completely understood. Here, we uncover the critical role of spatio-temporal genome architecture in this process. We demonstrate that p53 drives direct and indirect changes in genome compartments, topologically associating domains, and DNA loops prior to one hour of its activation, which escort the p53 transcriptional program. Focusing on p53-bound enhancers, we report 340 genes directly regulated by p53 over a median distance of 116 kb, with 74% of these genes not previously identified. Finally, we showcase that p53 controls transcription of distal genes through newly formed and pre-existing enhancer-promoter loops in a cohesin dependent manner. Collectively, our findings demonstrate a previously unappreciated architectural role of p53 as regulator at distinct topological layers and provide a reliable set of new p53 direct target genes that may help designs of cancer therapies. |
| Grants: | Agencia Estatal de Investigación PID2021-125277OB-I00 Agencia Estatal de Investigación PID2019-111243RA-I00 Ministerio de Ciencia e Innovación PRE2022-102463 Agència de Gestió d'Ajuts Universitaris i de Recerca 2019FI-B00017 European Commission 955534 "la Caixa" Foundation LCF/BQ/PR20/11770002 Agència de Gestió d'Ajuts Universitaris i de Recerca CP19/00176 Agència de Gestió d'Ajuts Universitaris i de Recerca CP22/00127 |
| Rights: | Aquest document està subjecte a una llicència d'ús Creative Commons. Es permet la reproducció total o parcial, la distribució, la comunicació pública de l'obra i la creació d'obres derivades, fins i tot amb finalitats comercials, sempre i quan es reconegui l'autoria de l'obra original.  |
| Language: | Anglès |
| Document: | Article ; recerca ; Versió publicada |
| Subject: | Chromatin ; Cohesins ; DNA ; Regulatory Sequences, Nucleic Acid ; Tumor Suppressor Protein p53 |
| Published in: | Nature communications, Vol. 15 Núm. 1 (december 2024) , p. 2821, ISSN 2041-1723 |
