Quantification of Histone H1 Subtypes Using Targeted Proteomics
López Gómez, Jordi (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular)
Villarreal, Laura (Institut de Recerca Biomèdica (Barcelona))
Andrés Nieto, Marta (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular)
Ponte Marull, Immaculada (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular)
Xicoy, Blanca (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Recerca contra la Leucèmia Josep Carreras)
Zamora, Lurdes (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Recerca contra la Leucèmia Josep Carreras)
Vilaseca, Marta (Institut de Recerca Biomèdica (Barcelona))
Roque Córdova, Alicia (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular)

Data:	2024
Descripció:	18 pàg.
Resum:	Histone H1 is involved in the regulation of chromatin structure. Human somatic cells express up to seven subtypes. The variability in the proportions of somatic H1s (H1 complement) is one piece of evidence supporting their functional specificity. Alterations in the protein levels of different H1 subtypes have been observed in cancer, suggesting their potential as biomarkers and that they might play a role in disease development. We have developed a mass spectrometry-based (MS) parallel reaction monitoring (PRM) assay suitable for the quantification of H1 subtypes. Our PRM method is based on the quantification of unique peptides for each subtype, providing high specificity. Evaluation of the PRM performance on three human cell lines, HeLa, K562, and T47D, showed high reproducibility and sensitivity. Quantification values agreed with the electrophoretic and Western blot data, indicating the accuracy of the method. We used PRM to quantify the H1 complement in peripheral blood samples of healthy individuals and chronic myeloid leukemia (CML) patients. In CML, the first line of therapy is a tyrosine kinase inhibitor, imatinib. Our preliminary data revealed differences in the H1 complement in CML patients between imatinib responders and non-responders. These results support further research to determine if the H1 content or subtype composition could help predict imatinib response.
Ajuts:	Agencia Estatal de Investigación BFU2017-82805-C2-2-P Agencia Estatal de Investigación PID2020-112783GB-C22
Drets:	Aquest document està subjecte a una llicència d'ús Creative Commons. Es permet la reproducció total o parcial, la distribució, la comunicació pública de l'obra i la creació d'obres derivades, fins i tot amb finalitats comercials, sempre i quan es reconegui l'autoria de l'obra original.
Llengua:	Anglès
Document:	Article ; recerca ; Versió publicada
Matèria:	Histone H1 ; Functional differentiation ; Cancer biomarker ; Chronic myeloid leukemia ; Imatinib resistance ; Parallel reaction monitoring
Publicat a:	Biomolecules, Vol. 14, Núm. 10 (September 2024) , ISSN 2218-273X

DOI: 10.3390/biom14101221
PMID: 39456154

18 p, 1.8 MB

El registre apareix a les col·leccions:
Documents de recerca > Documents dels grups de recerca de la UAB > Centres i grups de recerca (producció científica) > Ciències de la salut i biociències > Institut d'Investigació en Ciencies de la Salut Germans Trias i Pujol (IGTP) > Institut de Recerca contra la Leucèmia Josep Carreras
Articles > Articles de recerca
Articles > Articles publicats