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1.
11 p, 2.7 MB Genomic Scanning of Inbreeding Depression for Litter Size in Two Varieties of Iberian Pigs / Hervás Rivero, Carlos (Universidad de Zaragoza. Instituto Agroalimentario de Aragón) ; Srihi, Houssemeddine (Universidad de Zaragoza. Instituto Agroalimentario de Aragón) ; López Carbonell, David (Universidad de Zaragoza. Instituto Agroalimentario de Aragón) ; Casellas Vidal, Joaquim (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments) ; Ibañez-Escriche, Noelia (Universitat Politècnica de València. Instituto Universitario de Ciencia y Tecnología Animal) ; Negro, Sara (INGA FOOD S.A. Programa de Mejora Genética "Castua") ; Varona, Luis (Universidad de Zaragoza. Instituto Agroalimentario de Aragón)
Inbreeding depression is expected to be more pronounced in fitness-related traits, such as pig litter size. Recent studies have suggested that the genetic determinism of inbreeding depression may be heterogeneous across the genome. [...]
2023 - 10.3390/genes14101941
Genes, Vol. 14 (october 2023)  
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2.
7 p, 92.4 KB Empirical Bayes factor analyses of quantitative trait loci for gestation length in Iberian x Meishan F2 sows / Casellas Vidal, Joaquim (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments) ; Varona, Luis (IRTA-Lleida. Genètica I Millora Animal) ; Muñoz, G. (Instituto Nacional de Investigación y Tecnología Agraria y Alimentaria . Departamento de Mejora Genética Animal) ; Ramírez, O. (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments) ; Barragán, Carmen (Instituto Nacional de Investigación y Tecnología Agraria y Alimentaria . Departamento de Mejora Genética Animal) ; Tomás, A. (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments) ; Martínez-Giner, M. (IRTA-Lleida. Genètica I Millora Animal) ; Ovilo, Cristina (Instituto Nacional de Investigación y Tecnología Agraria y Alimentaria . Departamento de Mejora Genética Animal) ; Sánchez Bonastre, Armando (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments) ; Noguera, José Luis (IRTA-Lleida. Genètica I Millora Animal) ; Rodríguez, M.C. (Instituto Nacional de Investigación y Tecnología Agraria y Alimentaria . Departamento de Mejora Genética Animal)
The aim of this study was to investigate chromosomal regions affecting gestation length in sows. An experimental F2 cross between Iberian and Meishan pig breeds was used for this purpose and we genotyped 119 markers covering the 18 porcine autosomal chromosomes. [...]
2008 - 10.1017/S1751731107001085
Animal, Vol. 2 Núm. 2 (february 2008) , p. 177-183  
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3.
9 p, 1.9 MB A Bayesian Multivariate Gametic Model in a Reciprocal Cross with Genomic Information : An Example with Two Iberian Varieties / Srihi, Houssemeddine (Universidad de Zaragoza. Instituto Agroalimentario de Aragón) ; López Carbonell, David (Universidad de Zaragoza. Instituto Agroalimentario de Aragón) ; Ibañez-Escriche, Noelia (Universitat Politècnica de València. Instituto de Ciencia y Tecnología Animal) ; Casellas Vidal, Joaquim (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments) ; Hernández Penadés, Pilar (Universitat Politècnica de València. Instituto de Ciencia y Tecnología Animal) ; Negro, Sara (INGA FOOD S.A. Programa de Mejora Genética "Castúa") ; Varona, Luis (Universidad de Zaragoza. Instituto Agroalimentario de Aragón)
INGA FOOD, S. A. initiated a crossbreeding program involving two Iberian pig varieties: Retinto and Entrepelado. The primary objective of this program is to produce an F1 hybrid sow that exhibits enhanced reproductive performance. [...]
2023 - 10.3390/ani13101648
Animals, Vol. 13 (may 2023)  
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4.
20 p, 1.0 MB La función peine de Dirichlet y algunas funciones patológicas similares : propiedades analíticas y diofánticas / Varona Malumbres, Juan Luis (Universidad de La Rioja. Departamento de Matemáticas y Computación)
2022
Materials matemàtics, 2022  
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5.
15 p, 1.6 MB Use of Bayes factors to evaluate the effects of host genetics, litter and cage on the rabbit cecal microbiota / Velasco-Galilea, María (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Piles, Miriam (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries) ; Ramayo-Caldas, Yuliaxis (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries) ; Varona, Luis (Universidad de Zaragoza) ; Sánchez, Juan Pablo (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries)
The rabbit cecum hosts and interacts with a complex microbial ecosystem that contributes to the variation of traits of economic interest. Although the influence of host genetics on microbial diversity and specific microbial taxa has been studied in several species (e. [...]
2022 - 10.1186/s12711-022-00738-2
Genetics, selection, evolution, Vol. 54 (June 2022) , art. 46  
Registro completo - Creative Commons
6.
5 p, 560.6 KB Modeling Skewness in Human Transcriptomes / Casellas Vidal, Joaquim (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments) ; Varona, Luis (Universidad de Zaragoza. Departamento de Anatomía, Embriología y Genética Animal)
Gene expression data are influenced by multiple biological and technological factors leading to a wide range of dispersion scenarios, although skewed patterns are not commonly addressed in microarray analyses. [...]
2012 - 10.1371/journal.pone.0038919
PloS one, Vol. 7 (june 2012)  
Registro completo - Creative Commons
7.
12 p, 2.5 MB On the performance of tests for the detection of signatures of selection : a case study with the Spanish autochthonous beef cattle populations / González-Rodríguez, Aldemar (Universidad de Zaragoza. Departamento de Anatomía, Embriología y Genética Animal) ; Munilla, Sebastián (Universidad de Buenos Aires. Departamento de Producción Animal) ; Mouresan, Elena F. (Universidad de Zaragoza. Departamento de Anatomía, Embriología y Genética Animal) ; Cañas Álvarez, Jhon Jacobo (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments) ; Díaz, Clara (INIA Departamento de Mejora Genética Animal) ; Piedrafita Arilla, Jesús (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments) ; Altarriba, Juan (Instituto Agroalimentario de Aragón) ; Baro, Jesús Á. (Universidad de Valladolid. Departamento de Ciencias Agroforestales) ; Molina, Antonio (Universidad de Córdoba. MERAGEM) ; Varona, Luis (Instituto Agroalimentario de Aragón)
Procedures for the detection of signatures of selection can be classified according to the source of information they use to reject the null hypothesis of absence of selection. Three main groups of tests can be identified that are based on: (1) the analysis of the site frequency spectrum, (2) the study of the extension of the linkage disequilibrium across the length of the haplotypes that surround the polymorphism, and (3) the differentiation among populations. [...]
2016 - 10.1186/s12711-016-0258-1
Genetics, selection, evolution, Vol. 48 (october 2016)  
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8.
10 p, 1.1 MB A cross-specific multiplicative binomial recursive model for the analysis of perinatal mortality in a diallel cross among three varieties of Iberian pig / Varona, Luis (Universidad de Zaragoza. Departamento de Anatomía, Embriología y Genética Animal) ; Noguera, José Luis (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries. Centre de Recerca en Sanitat Animal) ; Casellas Vidal, Joaquim (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments) ; de Hijas Villalba, Melani Martín (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments) ; Rosas, Juan Pablo (Programa de Mejora Genética "Castúa") ; Ibañez-Escriche, Noelia (Universitat Politècnica de València. Departament de Ciència Animal)
Perinatal piglet mortality is an important factor in pig production from economic and animal welfare perspectives; however, the statistical analysis of mortality is difficult because of its categorical nature. [...]
2020 - 10.1038/s41598-020-78346-7
Scientific reports, Vol. 10 (december 2020)  
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9.
12 p, 1.3 MB Genetic inbreeding depression load for morphological traits and defects in the Pura Raza Española horse / Poyato-Bonilla, Julia (Universidad de Sevilla. Departamento de Ciencias Agroforestales) ; Perdomo-González, Davinia I. (Universidad de Sevilla. Departamento de Ciencias Agroforestales) ; Sánchez-Guerrero, María J. (Universidad de Sevilla. Departamento de Ciencias Agroforestales) ; Varona, Luis (Universidad de Zaragoza. Departamento de Anatomía, Embriología y Genética Animal) ; Molina, Antonio (Universidad de Córdoba. Departamento de Genética) ; Casellas Vidal, Joaquim (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments) ; Valera, Mercedes (Universidad de Sevilla. Departamento de Ciencias Agroforestales)
Inbreeding is caused by mating between related individuals and is associated with reduced fitness and performance (inbreeding depression). Several studies have detected heterogeneity in inbreeding depression among founder individuals. [...]
2020 - 10.1186/s12711-020-00582-2
Genetics, selection, evolution, Vol. 52 (october 2020)  
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10.
16 p, 719.7 KB Maternal Transmission Ratio Distortion in Two Iberian Pig Varieties / Vázquez-Gómez, Marta (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments) ; de Hijas Villalba, Melani Martín (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments) ; Varona, Luis (Universidad de Zaragoza. Departamento de Anatomía, Embriología y Genética Animal) ; Ibañez-Escriche, Noelia (Universitat Politècnica de València. Departament de Ciència Animal) ; Rosas, Juan Pablo (Inga Food. Programa de Mejora Genética 'Castúa') ; Negro, Sara (Inga Food. Programa de Mejora Genética 'Castúa') ; Noguera, José Luis (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries. Centre de Recerca en Sanitat Animal) ; Casellas Vidal, Joaquim (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments)
Transmission ratio distortion (TRD) is defined as the allele transmission deviation from the heterozygous parent to the offspring from the expected Mendelian genotypic frequencies. Although TRD can be a confounding factor in genetic mapping studies, this phenomenon remains mostly unknown in pigs, particularly in traditional breeds (i. [...]
2020 - 10.3390/genes11091050
Genes, Vol. 11 (september 2020)  
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