|
1.
|
|
20 p, 2.5 MB |
Functional Evolution of Clustered Aquaporin Genes Reveals Insights into the Oceanic Success of Teleost Eggs
/
Ferré, Alba (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ;
Chauvigné, François (Instituto de Ciencias del Mar - CSIC) ;
Vlasova, Anna (Institut de Ciència i Tecnologia de Barcelona. Institut de Recerca en Biomedicina) ;
Norberg, Birgitta (Austevoll Research Station. Institute of Marine Research) ;
Bargelloni, Luca (Università di Padova. Dipartimento di Biomedicina Comparata e Scienza dell'Alimentazione) ;
Guigó, Roderic (Institut de Ciència i Tecnologia de Barcelona. Institut de Recerca en Biomedicina) ;
Finn, Roderick Nigel (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ;
Cerdà, Joan (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí")
Aquaporin-mediated oocyte hydration is considered important for the evolution of pelagic eggs and the radiative success of marine teleosts. However, the molecular regulatory mechanisms controlling this vital process are not fully understood. [...]
2023 -  10.1093/molbev/msad071
Molecular biology and evolution, Vol. 40, Issue 4 (April 2023) , art. msad071
|
|
|
2.
|
|
19 p, 6.2 MB |
Extreme genomic erosion after recurrent demographic bottlenecks in the highly endangered Iberian lynx
/
Abascal, Federico (Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas) ;
Corvelo, André (Centre Nacional d'Anàlisi Genòmica) ;
Cruz, Fernando (Centre Nacional d'Anàlisi Genòmica) ;
Villanueva-Cañas, J. L. (Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques) ;
Vlasova, Anna (Centre de Regulació Genòmica) ;
Marcet-Houben, Marina (Centre de Regulació Genòmica) ;
Martínez-Cruz, B. (Estación Biológica de Doñana) ;
Cheng, J. Y. (Aarhus University. Bioinformatics Research Centre) ;
Prieto, P. (Centre de Regulació Genòmica) ;
Quesada, V. (Universidad de Oviedo. Instituto Universitario de Oncología) ;
Quilez, J. (Institut de Biologia Evolutiva (UPF-CSIC) (Barcelona)) ;
Li, G. (Texas A;M University. Department of Veterinary Integrative Biosciences) ;
García, Francisca (Universitat Autònoma de Barcelona. Servei de Cultius Cel·lulars, Producció d'Anticossos i Citometria) ;
Rubio-Camarillo, M. (Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas) ;
Frias, Leonor (Centre Nacional d'Anàlisi Genòmica) ;
Ribeca, Paolo (Centre Nacional d'Anàlisi Genòmica) ;
Capella-Gutiérrez, Salvador (Centre de Regulació Genòmica) ;
Rodríguez, J. M. (Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas) ;
Câmara, F. (Centre de Regulació Genòmica) ;
Lowy, Ernesto (Centre de Regulació Genòmica) ;
Cozzuto, Luca (Centre de Regulació Genòmica) ;
Erb, I. (Centre de Regulació Genòmica) ;
Tress, M. L. (Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas) ;
Rodriguez-Ales, J. L. (Centre de Regulació Genòmica) ;
Ruiz-Orera, J. (Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques) ;
Reverter, F. (Centre de Regulació Genòmica) ;
Casas-Marce, M. (Estación Biológica de Doñana) ;
Soriano, L. (Estación Biológica de Doñana) ;
Arango, Javier R (Universidad de Oviedo. Departamento de Bioquímica y Biología Molecular) ;
Derdak, Sophia (Centre Nacional d'Anàlisi Genòmica) ;
Galán, Beatriz (Centro de Investigaciones Biológicas (Madrid)) ;
Blanc, Julie (Centre Nacional d'Anàlisi Genòmica) ;
Gut, Marta (Centre Nacional d'Anàlisi Genòmica) ;
Lorente-Galdos, Belen (Institut de Biologia Evolutiva (UPF-CSIC) (Barcelona)) ;
Andrés Nieto, Marta (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ;
López-Otín, C. (Universidad de Oviedo. Departamento de Bioquímica y Biología Molecular) ;
Valencia, A. (Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas) ;
Gut, I. (Centre Nacional d'Anàlisi Genòmica) ;
García, J. L. (Centro de Investigaciones Biológicas (Madrid)) ;
Guigó, R. (Centre de Regulació Genòmica) ;
Murphy, W. J. (Texas A;M University. Department of Veterinary Integrative Biosciences) ;
Ruiz-Herrera Moreno, Aurora (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Biologia Cel·lular, de Fisiologia i d'Immunologia) ;
Marques-Bonet, Tomas. 1975- (Centre Nacional d'Anàlisi Genòmica) ;
Roma, Guglielmo (Centre de Regulació Genòmica) ;
Notredame, C. (Centre de Regulació Genòmica) ;
Mailund, Thomas (Aarhus University. Bioinformatics Research Centre) ;
Albà, M. Mar (Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques) ;
Gabaldón, Toni (Centre de Regulació Genòmica) ;
Alioto, Tyler Scott (Centre Nacional d'Anàlisi Genòmica) ;
Godoy, J. A. (Estación Biológica de Doñana)
Background: Genomic studies of endangered species provide insights into their evolution and demographic history, reveal patterns of genomic erosion that might limit their viability, and offer tools for their effective conservation. [...]
2016 - 10.1186/s13059-016-1090-1
Genome biology, Vol. 17 (2016) , art. 251
|
|
|
3.
|
|
50 p, 962.3 KB |
Transposons played a major role in the diversification between the closely related almond and peach genomes : Results from the almond genome sequence
/
Alioto, Tyler Scott (Centre de Regulació Genòmica) ;
Alexiou, Konstantinos G. (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Bardil, Amélie (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Barteri, Fabio (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Castanera, Raúl (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Cruz, Fernando (Centre de Regulació Genòmica) ;
Dhingra, Amit (Washington State University. Department of Horticulture) ;
Duval, Henri (Institut National de la Recherche Agronomique (França)) ;
Fernández i Martí, Angel (University of California) ;
Frias, Leonor (Centre de Regulació Genòmica) ;
Galán, Beatriz (Consejo Superior de Investigaciones Científicas) ;
García, José Luis (Consejo Superior de Investigaciones Científicas) ;
Howad, Werner (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Gómez-Garrido, Jessica (Centre de Regulació Genòmica) ;
Gut, Marta (Centre de Regulació Genòmica) ;
Julca, Irene (Centre de Regulació Genòmica) ;
Morata, Jordi (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Puigdomènech, Pere, 1948- (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Ribeca, Paolo (Centre de Regulació Genòmica) ;
Rubio Cabetas, María José (Centro de Investigación y Tecnología Agroalimentaria de Aragón) ;
Vlasova, Anna (Centre de Regulació Genòmica) ;
Wirthensohn, Michelle (The University of Adelaide. School of Agriculture, Food and Wine) ;
Garcia-Mas, Jordi (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Gabaldón, Toni (Centre de Regulació Genòmica) ;
Casacuberta i Suñer, Josep M. 1962- (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Arús i Gorina, Pere (Centre de Recerca en Agrigenòmica)
We sequenced the genome of the highly heterozygous almond Prunus dulcis cv. Texas combining short and long-read sequencing. We obtained a genome assembly totaling 227. 6 Mb of the estimated 238 Mb almond genome size, of which 91% is anchored to eight pseudomolecules corresponding to its haploid chromosome complement, and annotated 27,969 protein-coding genes and 6,747 non-coding transcripts. [...]
2020 - 10.1111/tpj.14538
The Plant journal, Vol. 101, Issue 2 (January 2020) , p. 455-472
|
|
|
4.
|
|
18 p, 3.4 MB |
Genome and transcriptome analysis of the Mesoamerican common bean and the role of gene duplications in establishing tissue and temporal specialization of genes
/
Vlasova, Anna (Centre de Regulació Genòmica) ;
Capella-Gutiérrez, Salvador (Centre de Regulació Genòmica) ;
Rendón-Anaya, Martha (Laboratorio Nacional de Genómica para la Biodiversidad) ;
Hernández-Oñate, Miguel (Laboratorio Nacional de Genómica para la Biodiversidad) ;
Minoche, André E. (Garvan Institute of Medical Research (Darlinghurst, Austràlia)) ;
Erb, Ionas (Centre de Regulació Genòmica) ;
Câmara, Francisco (Centre de Regulació Genòmica) ;
Prieto-Barja, Pablo (Centre de Regulació Genòmica) ;
Corvelo, André (New York Genome Center) ;
Sanseverino, Walter (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Westergaard, Gastón (Instituto de Agrobiotecnología Rosario) ;
Dohm, Juliane C. (Universität für Bodenkultur) ;
Pappas, Georgios J. (Universidade de Brasília. Departamento de Biologia Celular) ;
Saburido-Alvarez, Soledad (Laboratorio Nacional de Genómica para la Biodiversidad) ;
Kedra, Darek (Centre de Regulació Genòmica) ;
Gonzalez, Irene (Universitat Pompeu Fabra) ;
Cozzuto, Luca (Centre de Regulació Genòmica) ;
Gómez-Garrido, Jessica (Universitat Pompeu Fabra) ;
Aguilar-Morón, María A. (Universitat Pompeu Fabra) ;
Andreu, Nuria (Universitat Pompeu Fabra) ;
Aguilar, O. Mario (Universidad Nacional de La Plata. Instituto de Biotecnología y Biología Molecular) ;
Garcia-Mas, Jordi (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Zehnsdorf, Maik (Universitat Pompeu Fabra) ;
Vázquez, Martín P. (Instituto de Agrobiotecnología Rosario) ;
Delgado-Salinas, Alfonso (Universidad Nacional Autónoma de México. Departamento de Botánica) ;
Delaye, Luis (Centro de Investigación y de Estudios Avanzados del I.P.N. Unidad Irapuato. Departamento de Ingeniería Genética) ;
Lowy, Ernesto (European Bioinformatics Institute) ;
Mentaberry, Alejandro (Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales) ;
Vianello-Brondani, Rosana P. (Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária) ;
García, José Luis (Centro Superior de Investigaciones Científicas. Departamento de Biología Ambiental) ;
Alioto, Tyler Scott (Centre de Regulació Genòmica) ;
Sánchez, Federico (Universidad Nacional Autónoma de México. Departamento de Biología Molecular de Plantas) ;
Himmelbauer, Heinz (Universität für Bodenkultur) ;
Santalla, Marta (Centro Superior de Investigaciones Científicas. Mision Biológica de Galicia) ;
Notredame, Cedric (Universitat Pompeu Fabra) ;
Gabaldón, Toni (Institució Catalana de Recerca i Estudis Avançats) ;
Herrera-Estrella, Alfredo (centro de Investigación y de Estudios Avanzados del I.P.N. Unidad Irapuato. Laboratorio Nacional de Genómica para la Biodiversidad) ;
Guigó, Roderic (Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques)
Legumes are the third largest family of angiosperms and the second most important crop class. Legume genomes have been shaped by extensive large-scale gene duplications, including an approximately 58 million year old whole genome duplication shared by most crop legumes. [...]
2016 - 10.1186/s13059-016-0883-6
Genome biology, Vol. 17 (2016) , art. 32
|
|
|
5.
|
|
5 p, 2.6 MB |
PRGdb 2.0 : towards a community-based database model for the analysis of R-genes in plants
/
Sanseverino, Walter (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Hermoso, Antoni (Centre de Regulació Genòmica) ;
D'Alessandro, Raffaella (Università degli Studi di Napoli Federico II) ;
Vlasova, Anna (Centre de Regulació Genòmica) ;
Andolfo, Giuseppe (Università degli Studi di Napoli Federico II) ;
Frusciante, Luigi (Università degli Studi di Napoli Federico II) ;
Lowy, Ernesto (Centre de Regulació Genòmica) ;
Roma, Guglielmo (Centre de Regulació Genòmica) ;
Ercolano, Maria Raffaella (Università degli Studi di Napoli Federico II)
The Plant Resistance Genes database (PRGdb; http://prgdb. org) is a comprehensive resource on resistance genes (R-genes), a major class of genes in plant genomes that convey disease resistance against pathogens. [...]
2013 - 10.1093/nar/gks1183
Nucleic acids research, Vol. 41 (2013) , p. D1167-D1171
|
|
guest ::
email alert
or subscribe to the 
RSS feed.
