Cancer Genome Interpreter annotates the biological and clinical relevance of tumor alterations
Tamborero, David (Institut d'Investigació Mèdica Hospital del Mar (IMIM))
Rubio-Perez, Carlota (Institut d'Investigació Mèdica Hospital del Mar (IMIM))
Deu-Pons, Jordi (Institut d'Investigació Mèdica Hospital del Mar (IMIM))
Schroeder, Michael P. (Charité-Universitätsmedizin (Germany))
Vivancos, Ana (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia)
Rovira, Ana (Institut d'Investigació Mèdica Hospital del Mar (IMIM)- CIBERONC)
Tusquets, Ignasi (Institut d'Investigació Mèdica Hospital del Mar (IMIM))
Albanell, Joan (Institut d'Investigació Mèdica Hospital del Mar (IMIM))
Rodón Ahnert, Jordi (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia)
Tabernero Caturla, Josep (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia)
de Torres, Carmen (Institut de Recerca Pediàtrica. Hospital Sant Joan de Déu)
Dienstmann, Rodrigo (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia)
Gonzalez-Perez, Abel (Institut d'Investigació Mèdica Hospital del Mar (IMIM))
Lopez-Bigas, Nuria (Institució Catalana de Recerca i Estudis Avançats (ICREA))
Universitat Autònoma de Barcelona

Data:	2018
Resum:	While tumor genome sequencing has become widely available in clinical and research settings, the interpretation of tumor somatic variants remains an important bottleneck. Here we present the Cancer Genome Interpreter, a versatile platform that automates the interpretation of newly sequenced cancer genomes, annotating the potential of alterations detected in tumors to act as drivers and their possible effect on treatment response. The results are organized in different levels of evidence according to current knowledge, which we envision can support a broad range of oncology use cases. The resource is publicly available at http://www. cancergenomeinterpreter. org. The online version of this article (10. 1186/s13073-018-0531-8) contains supplementary material, which is available to authorized users.
Nota:	Altres ajuts: Fundació La Marató TV3
Nota:	Número d'acord de subvenció EC/H2020/634143
Nota:	Número d'acord de subvenció EC/H2020/682398
Nota:	Número d'acord de subvenció MINECO/SAF2015-74072-JIN
Nota:	Número d'acord de subvenció MINECO/BES2013-063354
Nota:	Número d'acord de subvenció MINECO/RYC-2013-14554
Drets:	Aquest document està subjecte a una llicència d'ús Creative Commons. Es permet la reproducció total o parcial, la distribució, la comunicació pública de l'obra i la creació d'obres derivades, fins i tot amb finalitats comercials, sempre i quan es reconegui l'autoria de l'obra original.
Llengua:	Anglès.
Document:	article ; recerca ; publishedVersion
Publicat a:	Genome Medicine, Vol. 10 (March 2018) , art. 25, ISSN 1756-994X

PMID: 29592813
DOI: 10.1186/s13073-018-0531-8

8 p, 2.4 MB

El registre apareix a les col·leccions:
Articles > Articles de recerca
Articles > Articles publicats