Identification of a de novo splicing variant in the Coffin-Siris gene, 1, in a patient with Angelman-like syndrome
Aguilera, Cinthia (Parc Taulí Hospital Universitari. Institut d'Investigació i Innovació Parc Taulí (I3PT))
Gabau, Elisabeth (Parc Taulí Hospital Universitari. Institut d'Investigació i Innovació Parc Taulí (I3PT))
Laurie, Steve (Centre de Regulació Genòmica)
Baena Díez, Neus (Parc Taulí Hospital Universitari. Institut d'Investigació i Innovació Parc Taulí (I3PT))
Derdak, Sophia (Centre de Regulació Genòmica)
Capdevila, Núria (Parc Taulí Hospital Universitari. Institut d'Investigació i Innovació Parc Taulí (I3PT))
Ramírez Mallafré, Ariadna (Parc Taulí Hospital Universitari. Institut d'Investigació i Innovació Parc Taulí (I3PT))
Delgadillo, Veronica (Parc Taulí Hospital Universitari. Institut d'Investigació i Innovació Parc Taulí (I3PT))
García-Catalan, Maria Jesus (Parc Taulí Hospital Universitari. Institut d'Investigació i Innovació Parc Taulí (I3PT))
Brun-Gasca, Carme (Parc Taulí Hospital Universitari. Institut d'Investigació i Innovació Parc Taulí (I3PT))
Guitart, Maria (Parc Taulí Hospital Universitari. Institut d'Investigació i Innovació Parc Taulí (I3PT))
Ruiz, Anna (Parc Taulí Hospital Universitari. Institut d'Investigació i Innovació Parc Taulí (I3PT))
Universitat Autònoma de Barcelona

Date:	2018
Abstract:	Patients affected by Angelman syndrome (AS) present severe intellectual disability, lack of speech, ataxia, seizures, abnormal electroencephalography (EEG), and a characteristic behavioral phenotype. Around 10% of patients with a clinical diagnosis of AS(AS-like) do not have an identifiable molecular defect. Some of these patients harbor alternative genetic defects that present overlapping features with AS. Trio whole-exome sequence was performed on patient and parent's DNA extracted from peripheral blood. Exome data were filtered according to a de novo autosomal dominant inheritance. cDNA analysis was carried out to assess the effect of the splice site variant. We identified a novel heterozygous SMARCE1 splicing variant that leads to an exon skipping in a patient with an Angelman-like phenotype. Missense variants in the SMARCE1 gene are known to cause Coffin-Siris syndrome (CSS), which is a rare congenital syndrome. Clinical reevaluation of the patient confirmed the presence of characteristic clinical features of CSS, many of them overlapping with AS. Taking into account the novel finding reported in this study, we consider that CSS should be added to the expanding list of differential diagnoses for AS.
Grants:	Instituto de Salud Carlos III PI16/01411
Note:	Altres ajuts: Institut d'Investigació i Innovació Parc Taulí I3PT, Grant/Award Number: CIR2016/025; Asociación Española de Síndrome de Angelman
Rights:	Aquest document està subjecte a una llicència d'ús Creative Commons. Es permet la reproducció total o parcial, la distribució, la comunicació pública de l'obra i la creació d'obres derivades, fins i tot amb finalitats comercials, sempre i quan es reconegui l'autoria de l'obra original.
Language:	Anglès
Document:	Article ; recerca ; Versió publicada
Subject:	Angelman syndrome (AS) ; Coffin-Siris syndrome (CSS) ; Exome sequencing ; SMARCEI
Published in:	Molecular genetics & genomic medicine, Vol. 7 (december 2018) , ISSN 2324-9269

DOI: 10.1002/mgg3.511
PMID: 30548424

6 p, 603.6 KB

The record appears in these collections:
Research literature > UAB research groups literature > Research Centres and Groups (research output) > Health sciences and biosciences > Parc Taulí Research and Innovation Institute (I3PT
Articles > Research articles
Articles > Published articles