A genome-wide association analysis for body, udder, and leg conformation traits recorded in Murciano-Granadina goats
Luigi Sierra, Maria Gracia (Centre de Recerca en Agrigenòmica)
Landi, Vincenzo (University of Bari "Aldo Moro")
Guan, Dailu (Centre de Recerca en Agrigenòmica)
Delgado Bermejo, Juan Vicente (Universidad de Córdoba. Departamento de Genética)
Castelló Farré, Anna (Centre de Recerca en Agrigenòmica)
Cabrera Pane, Betlem (Centre de Recerca en Agrigenòmica)
Mármol-Sánchez, Emilio (Centre de Recerca en Agrigenòmica)
Fernández Álvarez, Javier (Asociación Nacional de Criadores de Caprino de Raza Murciano-Granadina)
Gómez-Carpio, Mayra (Universidad de Córdoba. Departamento de Genética)
Martinez, Amparo (Universidad de Córdoba. Departamento de Genética)
Such i Martí, Francesc Xavier (Universitat Autònoma de Barcelona. Grup de Recerca en Remugants (G2R))
Jordana i Vidal, Jordi (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments)
Amills i Eras, Marcel (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments)

Data:	2020
Resum:	Morphological traits are of great importance to dairy goat production given their effect on phenotypes of economic interest. However, their underlying genomic architecture has not yet been extensively characterized. Herein, we aimed to identify genomic regions associated with body, udder, and leg conformation traits recorded in 825 Murciano-Granadina goats. We genotyped this resource population using the GoatSNP50 BeadChip (Illumina Inc. , San Diego, CA) and performed genome-wide association analyses using the GEMMA software. We found 2 genome-wide significant associations between markers rs268273468 [Capra hircus (CHI) 16:69617700] and rs268249346 (CHI 28:18321523) and medial suspensory ligament. In contrast, we did not detect any genome-wide significant associations for body and leg traits. Moreover, we found 12, 19, and 7 chromosome-wide significant associations for udder, body, and leg traits, respectively. Comparison of our data with previous studies revealed a low level of positional concordance between regions associated with morphological traits. In addition to technical factors, this lack of concordance could be due to a substantial level of genetic heterogeneity among breeds or to the strong polygenic background of morphological traits, which makes it difficult to detect genetic factors that have small phenotypic effects.
Ajuts:	Ministerio de Ciencia e Innovación AGL2016-76108-R Ministerio de Economía y Competitividad SEV-2015-0533 Ministerio de Economía y Competitividad BES-2017-079709 Ministerio de Educación, Cultura y Deporte FPU15/01733
Drets:	Aquest document està subjecte a una llicència d'ús Creative Commons. Es permet la reproducció total o parcial, la distribució, i la comunicació pública de l'obra, sempre que no sigui amb finalitats comercials, i sempre que es reconegui l'autoria de l'obra original. No es permet la creació d'obres derivades.
Llengua:	Anglès
Document:	Article ; recerca ; Versió acceptada per publicar
Matèria:	Genome-wide association study (GWAS) ; Goat ; Murciano-Granadina ; Morphological trait
Publicat a:	Journal of dairy science, Vol. 103, Issue 12 (December 2020) , p. 11605-11617, ISSN 1525-3198

DOI: 10.3168/jds.2020-18461
PMID: 33069406

Postprint 55 p, 2.5 MB

Supplementary table 2 xlsx file 16.0 KB

El registre apareix a les col·leccions:
Documents de recerca > Documents dels grups de recerca de la UAB > Centres i grups de recerca (producció científica) > Ciències > CRAG (Centre de Recerca en Agrigenòmica)
Articles > Articles de recerca
Articles > Articles publicats