A comprehensive study of common and rare genetic variants in spermatogenesis-related loci identifies new risk factors for idiopathic severe spermatogenic failure
Guzmán-Jiménez, Andrea (Instituto de Investigación Biosanitaria Ibs (Granada, Andalusia))
González-Muñoz, Sara (Instituto de Investigación Biosanitaria Ibs (Granada, Andalusia))
Cerván-Martín, Miriam (Instituto de Parasitología y Biomedicina López Neyra (Granada, Andalusia))
Garrido, Nicolás (Instituto de Investigación Sanitaria La Fe (València))
Castilla, José Antonio (Universidad de Granada)
Gonzálvo, María Carmen (Hospital Universitario Virgen de las Nieves (Granada))
Clavero, Ana (Hospital Universitario Virgen de las Nieves (Granada))
Molina, Marta (Hospital Universitario Virgen de las Nieves (Granada))
Luján, Saturnino (Hospital Universitari i Politècnic La Fe (València))
Santos-Ribeiro, Samuel (University of Lisbon (Portugal))
Vilches, Miguel Angel (Clínicas de Reproducción Asistida y Banco de Óvulos (Marbella))
Espuch, Andrea (Hospital Universitario Torrecárdenas (Almeria, Andalusia))
Maldonado, Vicente (UGC de Obstetricia y Ginecología. Complejo Hospitalario de Jaén (Andalusia))
Galiano-Gutiérrez, Noelia (VIDA RECOLETAS Sevilla (Sevilla, Andalusia))
Santamaría-López, Esther (VIDA RECOLETAS Sevilla (Sevilla, Andalusia))
González-Ravina, Cristina (Instituto de Investigación Sanitaria la Fe (IIS la Fe)(València))
Quintana-Ferraz, Fernando (Instituto de Investigación Sanitaria la Fe (IIS la Fe) (València))
Gómez, Susana (Instituto de Investigación Sanitaria la Fe (IIS la Fe) (València))
Amorós, David (Instituto de Investigación Sanitaria la Fe (IIS la Fe) (València))
Martínez-Granados, Luis (Hospital Universitario Príncipe de Asturias (Alcalá de Henares, Madrid))
Ortega-González, Yanira (Hospital Universitario de Canarias (La Laguna))
Burgos, Miguel (Universidad de Granada)
Pereira-Caetano, Iris (Instituto Nacional de Saúde Dr Ricardo Jorge (Portugal))
Bulbul, Ozgur (Humanitas Research Hospital (Itàlia))
Castellano, Stefano (Humanitas Research Hospital (Itàlia))
Romano, Massimo (Humanitas University (Itàlia))
Albani, Elena (Humanitas Research Hospital (Itàlia))
Bassas, Lluís (Hospital de la Santa Creu i Sant Pau (Barcelona, Catalunya))
Seixas, Susana (Universidade do Porto)
Gonçalves, João (Nova Medical School (Portugal))
Lopes, Alexandra M. (Universidade do Porto)
Larriba, Sara (Institut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge)
Palomino-Morales, Rogelio J. (Universidad de Granada)
Carmona, F. David (Instituto de Investigación Biosanitaria Ibs (Granada, Andalusia))
Bossini-Castillo, Lara (Instituto de Investigación Biosanitaria Ibs (Granada, Andalusia))
Universitat Autònoma de Barcelona

Data:	2024
Resum:	STUDY QUESTION: Can genome-wide genotyping data be analysed using a hypothesis-driven approach to enhance the understanding of the genetic basis of severe spermatogenic failure (SPGF) in male infertility? SUMMARY ANSWER: Our findings revealed a significant association between SPGF and the SHOC1 gene and identified three novel genes (PCSK4, AP3B1, and DLK1) along with 32 potentially pathogenic rare variants in 30 genes that contribute to this condition. WHAT IS KNOWN ALREADY: SPGF is a major cause of male infertility, often with an unknown aetiology. SPGF can be due to either multifactorial causes, including both common genetic variants in multiple genes and environmental factors, or highly damaging rare variants. Next-generation sequencing methods are useful for identifying rare mutations that explain monogenic forms of SPGF. Genome-wide association studies (GWASs) have become essential approaches for deciphering the intricate genetic landscape of complex diseases, offering a cost-effective and rapid means to genotype millions of genetic variants. Novel methods have demonstrated that GWAS datasets can be used to infer rare coding variants that are causal for male infertility phenotypes. However, this approach has not been previously applied to characterize the genetic component of a whole case-control cohort. STUDY DESIGN, SIZE, DURATION: We employed a hypothesis-driven approach focusing on all genetic variation identified, using a GWAS platform and subsequent genotype imputation, encompassing over 20 million polymorphisms and a total of 1571 SPGF patients and 2431 controls. Both common (minor allele frequency, MAF.
Ajuts:	Agencia Estatal de Investigación PID2020-120157RB-I00 Agència de Gestió d'Ajuts Universitaris i de Recerca 2021/SGR-052
Drets:	Aquest document està subjecte a una llicència d'ús Creative Commons. Es permet la reproducció total o parcial, la distribució, la comunicació pública de l'obra i la creació d'obres derivades, fins i tot amb finalitats comercials, sempre i quan es reconegui l'autoria de l'obra original.
Llengua:	Anglès
Document:	Article ; recerca ; Versió publicada
Matèria:	Genetics ; Idiopathic spermatogenic failure ; Male infertility ; Monogenic mutations ; Polygenic susceptibility ; Spermatogenesis
Publicat a:	Human Reproduction Open, Vol. 2024 Núm. 4 (2024) , p. hoae069, ISSN 2399-3529

DOI: 10.1093/hropen/hoae069
PMID: 39678461

12 p, 1.3 MB

El registre apareix a les col·leccions:
Articles > Articles de recerca
Articles > Articles publicats