The interferon γ pathway enhances pluripotency and X-chromosome reactivation in iPSC reprogramming
Barrero, Mercedes (Institut de Ciència i Tecnologia de Barcelona. Institut de Recerca en Biomedicina)
Lazarenkov, Aleksey (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Recerca contra la Leucèmia Josep Carreras)
Blanco, Enrique (Institut de Ciència i Tecnologia de Barcelona. Institut de Recerca en Biomedicina)
Palma, Luis G. (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Recerca contra la Leucèmia Josep Carreras)
López-Rubio, Anna V. (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Recerca contra la Leucèmia Josep Carreras)
Bauer, Moritz (Institut de Ciència i Tecnologia de Barcelona. Institut de Recerca en Biomedicina)
Bigas Salvans, Anna (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Recerca contra la Leucèmia Josep Carreras)
Di Croce, Luciano (Institució Catalana de Recerca i Estudis Avançats)
Sardina, José Luis (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Recerca contra la Leucèmia Josep Carreras)
Payer, Bernhard (Universitat Pompeu Fabra)
Universitat Autònoma de Barcelona

Date:	2024
Abstract:	Reprogramming somatic cells into induced pluripotent stem cells (iPSCs) requires activation of the pluripotency network and resetting of the epigenome by erasing the epigenetic memory of the somatic state. In female mouse cells, a critical epigenetic reprogramming step is the reactivation of the inactive X chromosome. Despite its importance, a systematic understanding of the regulatory networks linking pluripotency and X-reactivation is missing. Here, we reveal important pathways for pluripotency acquisition and X-reactivation using a genome-wide CRISPR screen during neural precursor to iPSC reprogramming. In particular, we discover that activation of the interferon γ (IFNγ) pathway early during reprogramming accelerates pluripotency acquisition and X-reactivation. IFNγ stimulates STAT3 signaling and the pluripotency network and leads to enhanced TET-mediated DNA demethylation, which consequently boosts X-reactivation. We therefore gain a mechanistic understanding of the role of IFNγ in reprogramming and X-reactivation and provide a comprehensive resource of the molecular networks involved in these processes.
Grants:	Agencia Estatal de Investigación PID2021-123383NB-I00 Agencia Estatal de Investigación PID2019-111243RA-I00 Agencia Estatal de Investigación PID2022-142679NB-I00 Agència de Gestió d'Ajuts Universitaris i de Recerca 2017/SGR-346 Agència de Gestió d'Ajuts Universitaris i de Recerca 2021/SGR-01222
Rights:	Aquest document està subjecte a una llicència d'ús Creative Commons. Es permet la reproducció total o parcial, la distribució, la comunicació pública de l'obra i la creació d'obres derivades, fins i tot amb finalitats comercials, sempre i quan es reconegui l'autoria de l'obra original.
Language:	Anglès
Document:	Article ; recerca ; Versió publicada
Subject:	Cell reprogramming ; Epigenetic memory ; Epigenetics ; Epigenomes ; Induced pluripotent stem cells ; Mouse cells ; Pluripotency ; Regulatory network ; Somatic cells ; X chromosomes ; Animals ; Cellular Reprogramming ; DNA Methylation ; Epigenesis, Genetic ; Female ; Induced Pluripotent Stem Cells ; Interferon-gamma ; Mice ; Signal Transduction ; STAT3 Transcription Factor ; X Chromosome
Published in:	Science advances, Vol. 10 Núm. 32 (august 2024) , p. adj8862, ISSN 2375-2548

DOI: 10.1126/sciadv.adj8862
PMID: 39110794

24 p, 9.9 MB

The record appears in these collections:
Research literature > UAB research groups literature > Research Centres and Groups (research output) > Health sciences and biosciences > Institut d'Investigació en Ciencies de la Salut Germans Trias i Pujol (IGTP) > Josep Carreras Leukaemia Research Institute
Articles > Research articles
Articles > Published articles