Sequential and structural deteminants of protein aggregation
Sánchez de Groot, Natalia
Vendrell i Roca, Josep, ![Identificador ORCID](/img/uab/orcid.ico)
dir. (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular)
Ventura Zamora, Salvador, dir. (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular)
Universitat Autònoma de Barcelona.
Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular
Publicación: |
Bellaterra: Universitat Autònoma de Barcelona, 2010 |
Resumen: |
The project entitled "Sequential and structural determinants of protein aggregation" aims to study the factors that control protein deposition but also tries to develop new strategies to facilitate its comprehension. Protein aggregation is related with an increasing number of human disorders such as Alzheimer's disease, Parkinson disease or type II diabetes. Understanding the determinants that modulate the deposition process is a necessary step to develop new strategies to tackle these debilitating pathologies. Additionally, the accumulation of heterologous protein as intracellular aggregates during recombinant expression represents one of the main problems in down stream processing. Accordingly, understanding the factors behind the production of recombinant protein might lead to new avenues to increase the solubility and functionality of recombinant proteins. During the development of the present thesis we have used a wide range of techniques to analyse protein aggregation process in three different frameworks: in vitro, in vivo and in silico. The depositional properties of polypeptides differing in structure, sequence, and function were studied. The data obtained reveal the importance of the intrinsic polypeptide chain properties to protein aggregation and reveal the general rules controlling polypeptide deposition. This information permitted the development of an algorithm able to locate key depositional regions and calculate the global aggregation propensity of a protein starting from their amino acid sequence. This tool can be used for the analysis of the aggregation properties of large protein sets as show here for cytosolic bacterial proteins. Overall, the results collected in the present thesis could be valuable for biomedicine area suggesting new therapeutic targets to fight against depositional diseases as well as new approaches to increase the protein quality during protein production. It is also shown that folding and aggregation turn two be two side of the same coin that compete with each other. |
Nota: |
Descripció del recurs: el 1 de febrer de 2011 |
Nota: |
Tesi doctoral - Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i Biologia Molecular, 2010 |
Nota: |
Bibliografia |
Derechos: |
ADVERTIMENT. L'accés als continguts d'aquesta tesi doctoral i la seva utilització ha de respectar els drets de la persona autora. Pot ser utilitzada per a consulta o estudi personal, així com en activitats o materials d'investigació i docència en els termes establerts a l'art. 32 del Text Refós de la Llei de Propietat Intel·lectual (RDL 1/1996). Per altres utilitzacions es requereix l'autorització prèvia i expressa de la persona autora. En qualsevol cas, en la utilització dels seus continguts caldrà indicar de forma clara el nom i cognoms de la persona autora i el títol de la tesi doctoral. No s'autoritza la seva reproducció o altres formes d'explotació efectuades amb finalitats de lucre ni la seva comunicació pública des d'un lloc aliè al servei TDX. Tampoc s'autoritza la presentació del seu contingut en una finestra o marc aliè a TDX (framing). Aquesta reserva de drets afecta tant als continguts de la tesi com als seus resums i índexs. ![](/img/licenses/InC.ico) |
Lengua: |
Anglès |
Documento: |
Tesi doctoral |
Materia: |
Proteïnes ;
Agregació ;
Escherichia coli |
ISBN: |
978-84-693-2053-2 |
Adreça alternativa:: https://hdl.handle.net/10803/3625
Adreça alternativa: https://www.educacion.gob.es/teseo/mostrarRef.do?ref=852036
85 p, 4.3 MB
|
150 p, 10.3 MB
|
El registro aparece en las colecciones:
Documentos de investigación >
Tesis doctorales
Registro creado el 2011-03-07, última modificación el 2022-09-28