|
1.
|
|
|
Studying Hepatitis B and Hepatitis Delta viruses quasispecies by Next-generation sequencing : Conservation, variability, and interaction
/
Pacín Ruiz, Beatriz ;
Cortese, Maria Francesca, dir. ;
Rodríguez Frías, Francisco, dir.
El virus de l'hepatitis B (VHB) afecta uns 296 milions de persones arreu del món, més del 5% coinfectades amb el virus de l'hepatitis delta (VHD), causant l'hepatitis vírica més greu. El VHD presenta un domini d'ARN auto-catalític, la ribozima, i una regió que codifica per l'única proteïna viral, l'antigen delta (HDAg). [...]
El virus de la hepatitis B (VHB) afecta a unos 296 millones de personas, más del 5% coinfectadas con el virus de la hepatitis delta (VHD), causando la hepatitis vírica más grave. El VHD presenta un dominio de RNA auto-catalítico, la ribozima, y una región que codifica para la única proteína viral, denominada antígeno delta (HDAg). [...]
The Hepatitis B virus (HBV) affects around 296 million people worldwide. Of them, more than 5% are coinfected with Hepatitis delta virus (HDV), causing the most severe viral hepatitis. HDV is a viroid-like virus since it presents a catalytically active RNA portion known as ribozyme, and a region encoding for the unique viral protein, called delta antigen (HDAg). [...]
2023
|
|
|
2.
|
|
|
Study of similarities and differences between circulating hepatitis B virus RNA and DNA quasispecies in different regions of viral genome and development of an antiviral gene therapy strategy
/
García García, Selene ;
Cortese, Maria Francesca, dir. ;
Tabernero Caellas, David, dir. ;
Rodríguez Frías, Francisco, dir.
Al 2019, la Organització Mundial de la Salut (OMS) va estimar que 296 milions de persones a tot el món vivia amb infecció crònica pel virus de la hepatitis B (VHB), amb 1,5 milions de noves infeccions per any malgrat la disponibilitat d'una vacuna segura i eficaç. [...]
En 2019 la Organización Mundial de la Salud (OMS) estimó que 296 millones de personas en todo el mundo vivían con infección crónica por el virus de la hepatitis B (VHB), con 1,5 millones de nuevas infecciones por año, a pesar de la disponibilidad de una vacuna segura y efectiva. [...]
The World Health Organization (WHO) estimated that, in 2019, 296 million people worldwide were living with chronic hepatitis B virus (HBV) infection, with 1. 5 million new infections each year despite the availability of a safe and effective vaccine. [...]
2023
|
|
|
3.
|
|
16 p, 1.9 MB |
Cross-sectional evaluation of circulating hepatitis B virus RNA and DNA : Different quasispecies?
/
García-García, Selene (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Cortese, Maria Francesca (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Tabernero, David (Instituto de Salud Carlos II) ;
Gregori i Font, Josep (Instituto de Salud Carlos II) ;
Vila, Marta (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Pacín Ruiz, Beatriz (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Quer, Josep 1963- (Instituto de Salud Carlos II) ;
Casillas, Rosario (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Castillo-Ribelles, Laura (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Ferrer-Costa, Roser (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Rando-Segura, Ariadna (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Trejo-Zahínos, Jesús (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Pumarola Suñé, Tomàs (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Casis-Saez, Ernesto (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Esteban, Rafael (Instituto de Salud Carlos II) ;
Riveiro Barciela, Mar (Instituto de Salud Carlos II) ;
Buti, Maria (Instituto de Salud Carlos II) ;
Rodríguez Frías, Francisco (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Universitat Autònoma de Barcelona
Different forms of pregenomic and other hepatitis B virus (HBV) RNA have been detected in patients' sera. These circulating HBV-RNAs may be useful for monitoring covalently closed circular DNA activity, and predicting hepatitis B e-antigen seroconversion or viral rebound after nucleos(t)ide analog cessation. [...]
2021 -  10.3748/wjg.v27.i41.7144
World Journal of Gastroenterology, Vol. 27 (november 2021) , p. 7144-7158
|
|
|
4.
|
|
17 p, 2.4 MB |
Quasispecies Fitness Partition to Characterize the Molecular Status of a Viral Population. Negative Effect of Early Ribavirin Discontinuation in a Chronically Infected HEV Patient
/
Gregori i Font, Josep (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Colomer-Castell, Sergi (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Campos, Carolina (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Ibañez-Lligoña, Marta (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Garcia-Cehic, D. (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Rando-Segura, Ariadna (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Adombie, Caroline Melanie (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Pintó, Rosa (Universitat de Barcelona) ;
Guix, Susana (Universitat de Barcelona) ;
Bosch, Albert (Universitat de Barcelona) ;
Domingo, Esteban (Instituto de Salud Carlos III) ;
Gallego, Isabel (Centro de Biología Molecular Severo Ochoa) ;
Perales Viejo, Celia (Universidad Autónoma de Madrid) ;
Cortese, Maria Francesca (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Tabernero, David (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Buti, Maria (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Riveiro Barciela, Mar (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Esteban Mur, Juan Ignacio (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Rodríguez Frías, Francisco (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Quer, Josep 1963- (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Universitat Autònoma de Barcelona
The changes occurring in viral quasispecies populations during infection have been monitored using diversity indices, nucleotide diversity, and several other indices to summarize the quasispecies structure in a single value. [...]
2022 - 10.3390/ijms232314654
International journal of molecular sciences, Vol. 23 (november 2022)
|
|
|
5.
|
|
18 p, 1.0 MB |
Hepatitis B Virus Variants with Multiple Insertions and/or Deletions in the X Open Reading Frame 3' End : Common Members of Viral Quasispecies in Chronic Hepatitis B Patients
/
García-García, Selene (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular) ;
Caballero, Andrea (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Tabernero, David (Centro de Investigación Biomédica en Red de Enfermedades Hepáticas y Digestivas) ;
Cortese, Maria Francesca (Centro de Investigación Biomédica en Red de Enfermedades Hepáticas y Digestivas) ;
Gregori i Font, Josep (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Rodriguez-Algarra, Francisco (Queen Mary University of London) ;
Quer, Josep 1963- (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular) ;
Riveiro Barciela, Mar (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Homs, Maria (Institut Català de la Salut) ;
Rando-Segura, Ariadna (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Pacín Ruiz, Beatriz (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular) ;
Vila, Marta (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Ferrer-Costa, Roser (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Pumarola Suñé, Tomàs (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Buti, Maria (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Rodríguez Frías, Francisco (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular)
Deletions in the 3' end region of the hepatitis B virus (HBV) X open reading frame (HBX) may affect the core promoter (Cp) and have been frequently associated with hepatocellular carcinoma (HCC). The aim of this study was to investigate the presence of variants with deletions and/or insertions (Indels) in this region in the quasispecies of 50 chronic hepatitis B (CHB) patients without HCC. [...]
2022 - 10.3390/biomedicines10051194
Biomedicines, Vol. 10, Issue 5 (May 2022) , art. 1194
|
|
|
6.
|
|
23 p, 2.1 MB |
Next-Generation Sequencing for Confronting Virus Pandemics
/
Quer, Josep 1963- (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular) ;
Colomer-Castell, Sergi (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Campos, Carolina (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Andrés, Cristina (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Piñana, Maria (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Cortese, Maria Francesca (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
González-Sánchez, Alejandra (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Garcia-Cehic, D. (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Ibáñez, Marta (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Pumarola Suñé, Tomàs (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular) ;
Rodríguez Frías, Francisco (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular) ;
Antón, Andrés (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia) ;
Tabernero, David (Hospital Universitari Vall d'Hebron)
Virus pandemics have happened, are happening and will happen again. In recent decades, the rate of zoonotic viral spillover into humans has accelerated, mirroring the expansion of our global footprint and travel network, including the expansion of viral vectors and the destruction of natural spaces, bringing humans closer to wild animals. [...]
2022 - 10.3390/v14030600
Viruses, Vol. 14 (march 2022)
|
|
|
7.
|
|
13 p, 1.5 MB |
Inspecting the Ribozyme Region of Hepatitis Delta Virus Genotype 1 : Conservation and Variability
/
Pacín Ruiz, Beatriz (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Cortese, Maria Francesca (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Tabernero, David (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Sopena, Sara (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Gregori i Font, Josep (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
García-García, Selene (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Casillas, Rosario (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Najarro-Centeno, Adrián (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Aldama, Unai (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Palom, Adriana (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Rando-Segura, Ariadna (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Galán, Anna (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Vila, Marta (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Riveiro Barciela, Mar (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Quer, Josep 1963- (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
González-Aseguinolaza, Gloria (Univerdad de Pamplona) ;
Buti, Maria (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Rodríguez Frías, Francisco (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular)
The hepatitis delta virus (HDV) genome has an autocatalytic region called the ribozyme, which is essential for viral replication. The aim of this study was to use next-generation sequencing (NGS) to analyze the ribozyme quasispecies (QS) in order to study its evolution and identify highly conserved regions potentially suitable for a gene-silencing strategy. [...]
2022 - 10.3390/v14020215
Viruses, Vol. 14 (january 2022)
|
|
|
8.
|
|
11 p, 1.1 MB |
Sophisticated viral quasispecies with a genotype-related pattern of mutations in the hepatitis B X gene of HBeAg-ve chronically infected patients
/
Cortese, Maria Francesca (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
González, Carolina (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Gregori i Font, Josep (Roche Diagnostics (Sant Cugat)) ;
Casillas, Rosario (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Carioti, Luca (University of Rome Tor Vergata) ;
Guerrero Murillo, Mercedes (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Riveiro Barciela, Mar (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Godoy, Cristina (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Sopena, Sara (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Yll, Marçal (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Quer, Josep 1963- (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Rando-Segura, Ariadna (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Lopez-Martinez, Rosa (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Pacín Ruiz, Beatriz (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
García-García, Selene (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Esteban, Rafael (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Tabernero, David (Centro de Investigación Biomédica en Red de Enfermedades Hepáticas y Digestivas) ;
Buti, Maria (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Rodríguez Frías, Francisco (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Universitat Autònoma de Barcelona
Patients with HBeAg-negative chronic infection (CI) have not been extensively studied because of low viremia. The HBx protein, encoded by HBX, has a key role in viral replication. Here, we analyzed the viral quasispecies at the 5' end of HBX in CI patients and compared it with that of patients in other clinical stages. [...]
2021 - 10.1038/s41598-021-83762-4
Scientific reports, Vol. 11 (february 2021)
|
|
|
9.
|
|
169 p, 5.4 MB |
Estudio de la quasiespecies del virus de la hepatitis B a través de secuenciación masiva para la identificación de dianas terapéuticas y factores pronósticos
/
Yll, Marçal ;
Rodríguez Frías, Francisco, dir. ;
Buti, Maria, dir. ;
Cortese, Maria Francesca, dir.
Tot i tenir una vacuna preventiva eficaç, el virus de l'hepatitis B (VHB) és un greu problema de salut mundial degut a la seva elevada prevalença (afecta a més de 250 milions de persones a tot el món) i a la morbiditat que deriva de la seva cronicitat, ja que és el primer factor virològic de risc en el desenvolupament de carcinoma hepatocel·lular (HCC). [...]
A pesar de tener una vacuna preventiva eficaz, el virus de la hepatitis B (VHB) es un grave problema de salud mundial debido a su elevada prevalencia (afecta a más de 250 millones de personas en todo el mundo) y a la morbilidad que deriva de su cronicidad, pues es el primer factor virológico de riesgo en el desarrollo de carcinoma hepatocelular (HCC). [...]
Despite having an effective preventive vaccine, the hepatitis B virus (HBV) is a serious global health problem due to its high prevalence (it affects more than 250 million people worldwide) and the morbidity derived from its chronicity, as it is the first virological risk factor in the development of hepatocellular carcinoma (HCC). [...]
2020
|
|
|
10.
|
|
16 p, 3.5 MB |
Conservation and variability of hepatitis B core at different chronic hepatitis stages
/
Yll, Marçal (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Cortese, Maria Francesca (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Guerrero Murillo, Mercedes (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Orriols, Gerard (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Gregori i Font, Josep (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Casillas, Rosario (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
González, Carolina (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Sopena, Sara (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Godoy, Cristina (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Vila, Marta (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Tabernero, David (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Quer, Josep 1963- (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Rando-Segura, Ariadna (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Lopez Martinez, Rosa (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Esteban, Rafael (Esteban Mur) (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Riveiro Barciela, Mar (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Buti, Maria (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Rodríguez Frías, Francisco (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Universitat Autònoma de Barcelona
Since it is currently not possible to eradicate hepatitis B virus (HBV) infection with existing treatments, research continues to uncover new therapeutic strategies. HBV core protein, encoded by the HBV core gene (HBC), intervenes in both structural and functional processes, and is a key protein in the HBV life cycle. [...]
2020 - 10.3748/wjg.v26.i20.2584
World Journal of Gastroenterology, Vol. 26 (may 2020) , p. 2584-2598
|
|
guest ::
email alert
or subscribe to the 
RSS feed.
