1.
|
19 p, 11.0 MB |
Annexin A6 modulates TBC1D15/Rab7/StARD3 axis to control endosomal cholesterol export in NPC1 cells
/
Meneses-Salas, Elsa (Centre de Recerca Biomèdica CELLEX) ;
García-Melero, Ana (Universitat de Barcelona) ;
Kanerva, Kristiina (Minerva Foundation Institute for Medical Research) ;
Blanco-Muñoz, Patricia (Centre de Recerca Biomèdica CELLEX) ;
Morales-Paytuvi, Frederic (Centre de Recerca Biomèdica CELLEX) ;
Bonjoch, Júlia (Centre de Recerca Biomèdica CELLEX) ;
Casas, Josefina (Institute for Advanced Chemistry of Catalonia (IQAC-CSIC)) ;
Egert, Antonia (University of Sydney) ;
Beevi, Syed S. (University of Sydney) ;
Jose, Jaimy (University of Sydney) ;
Llorente-Cortes, Vicenta (Institut d'Investigació Biomèdica Sant Pau) ;
Rye, Kerry-Anne (University of New South Wales) ;
Heeren, Joerg (University Medical Center Hamburg-Eppendorf) ;
Lu, Albert (Stanford University School of Medicine) ;
Pol, Albert (Institució Catalana de Recerca i Estudis Avançats) ;
Tebar, Francesc (Centre de Recerca Biomèdica CELLEX) ;
Ikonen, Elina (Minerva Foundation Institute for Medical Research) ;
Grewal, Thomas (University of Sydney) ;
Enrich, Carlos (Centre de Recerca Biomèdica CELLEX) ;
Rentero, Carles (Centre de Recerca Biomèdica CELLEX) ;
Universitat Autònoma de Barcelona
Cholesterol accumulation in late endosomes is a prevailing phenotype of Niemann-Pick type C1 (NPC1) mutant cells. Likewise, annexin A6 (AnxA6) overexpression induces a phenotype reminiscent of NPC1 mutant cells. [...]
2020 - 10.1007/s00018-019-03330-y
Cellular and Molecular Life Sciences, Vol. 77 Núm. 14 (january 2020) , p. 2839-2857
|
|
2.
|
|
3.
|
15 p, 5.0 MB |
3D chromatin remodelling in the germ line modulates genome evolutionary plasticity
/
Álvarez-González, Lucía (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ;
Burden, Frances (University of Kent. School of Bioscience) ;
Doddamani, Dadakhalandar (University of Kent. School of Bioscience) ;
Malinverni, Roberto (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Recerca contra la Leucèmia Josep Carreras) ;
Leach, Emma (University of Kent. School of Bioscience) ;
Marín-García, Cristina (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ;
Marin Gual, Laia (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ;
Gubern Burset, Albert (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Biologia Cel·lular, de Fisiologia i d'Immunologia) ;
Vara González, Covadonga (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Biologia Cel·lular, de Fisiologia i d'Immunologia) ;
Paytuví-Gallart, Andreu (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ;
Buschbeck, Marcus (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Recerca contra la Leucèmia Josep Carreras) ;
Ellis, Peter J. I. (University of Kent. School of Bioscience) ;
Farré, Marta (University of Kent. School of Bioscience) ;
Ruiz-Herrera Moreno, Aurora (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí")
Chromosome folding has profound impacts on gene regulation, whose evolutionary consequences are far from being understood. Here we explore the relationship between 3D chromatin remodelling in mouse germ cells and evolutionary changes in genome structure. [...]
2022 - 10.1038/s41467-022-30296-6
Nature communications, Vol. 13 (May 2022) , art. 2608
|
|
4.
|
17 p, 7.4 MB |
The impact of chromosomal fusions on 3D genome folding and recombination in the germ line
/
Vara González, Covadonga (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ;
Paytuví-Gallart, Andreu (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Biologia Cel·lular, de Fisiologia i d'Immunologia) ;
Cuartero, Yasmina (Centre de Regulació Genòmica) ;
Álvarez-González, Lucía (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ;
Marin Gual, Laia (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Biologia Cel·lular, de Fisiologia i d'Immunologia) ;
García, Francisca (Universitat Autònoma de Barcelona. Servei de Cultius Cel·lulars, Producció d'Anticossos i Citometria) ;
Florit-Sabater, Beatriu (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ;
Capilla, Laia (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Biologia Animal, de Biologia Vegetal i d'Ecologia) ;
Sanchéz-Guillén, Rosa Ana (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ;
Sarrate Navas, Zaida (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Biologia Cel·lular, de Fisiologia i d'Immunologia) ;
Aiese Cigliano, Riccardo (Sequentia Biotech) ;
Sanseverino, Walter (Sequentia Biotech) ;
Searle, Jeremy B. (Cornell University. Department of Ecology and Evolutionary Biology) ;
Ventura Queija, Jacinto (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Biologia Animal, de Biologia Vegetal i d'Ecologia) ;
Marti-Renom, Marc A. (Institució Catalana de Recerca i Estudis Avançats) ;
Le Dily, François (Centre de Regulació Genòmica) ;
Ruiz-Herrera Moreno, Aurora (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí")
The spatial folding of chromosomes inside the nucleus has regulatory effects on gene expression, yet the impact of genome reshuffling on this organization remains unclear. Here, we take advantage of chromosome conformation capture in combination with single-nucleotide polymorphism (SNP) genotyping and analysis of crossover events to study how the higher-order chromatin organization and recombination landscapes are affected by chromosomal fusions in the mammalian germ line. [...]
2021 - 10.1038/s41467-021-23270-1
Nature communications, Vol. 12 (May 2021) , art. 2981
|
|
5.
|
26 p, 7.4 MB |
Three-dimensional genomic structure and cohesin occupancy correlate with transcriptional activity during spermatogenesis
/
Vara González, Covadonga (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ;
Paytuví-Gallart, Andreu (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ;
Cuartero, Yasmina (Centre de Regulació Genòmica) ;
Le Dily, François (Centre de Regulació Genòmica) ;
García, Francisca (Universitat Autònoma de Barcelona. Servei de Cultius Cel·lulars, Producció d'Anticossos i Citometria) ;
Salvà Castro, Judith (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ;
Gomez Hernández, Laura (Centro de Investigación del Cáncer) ;
Julià, Eva (Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques) ;
Moutinho, Catia (Centre de Regulació Genòmica) ;
Aiese Cigliano, Riccardo (Sequentia Biotech) ;
Sanseverino, Walter (Sequentia Biotech) ;
Fornas, Òscar (Centre de Regulació Genòmica) ;
Martín Pendas, Alberto (Centro de Investigación del Cáncer) ;
Heyn, Holger (Centre de Regulació Genòmica) ;
Waters, Paul D. (University of New South Wales. School of Biotechnology and Biomolecular Sciences) ;
Martí Renom, Marc A. (Centre de Regulació Genòmica) ;
Ruiz-Herrera Moreno, Aurora (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Biologia Cel·lular, de Fisiologia i d'Immunologia)
Mammalian gametogenesis involves dramatic and tightly regulated chromatin remodeling, whose regulatory pathways remain largely unexplored. Here, we generate a comprehensive high-resolution structural and functional atlas of mouse spermatogenesis by combining in situ chromosome conformation capture sequencing (Hi-C), RNA sequencing (RNA-seq), and chromatin immunoprecipitation sequencing (ChIP-seq) of CCCTC-binding factor (CTCF) and meiotic cohesins, coupled with confocal and super-resolution microscopy. [...]
2019 - 10.1016/j.celrep.2019.06.037
Cell reports, Vol. 28, issue 2 (Jul. 2019) , p. 352-367
|
|
6.
|
15 p, 962.2 KB |
Mammalian comparative genomics reveals genetic and epigenetic features associated with genome reshuffling in Rodentia
/
Capilla Pérez, Laia (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Biologia Animal, de Biologia Vegetal i d'Ecologia) ;
Sánchez-Guillén, Rosa Ana (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ;
Farré, Marta (Instituto de Ecología A.C (Mèxic)) ;
Paytuví-Gallart, Andreu (Sequentia Biotech S.L.) ;
Malinverni, Roberto (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Biologia Cel·lular, de Fisiologia i d'Immunologia) ;
Ventura Queija, Jacinto (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Biologia Animal, de Biologia Vegetal i d'Ecologia) ;
Larkin, Denis M. (Instituto de Ecología A.C (Mèxic)) ;
Ruiz-Herrera Moreno, Aurora (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí")
Understanding how mammalian genomes have been reshuffled through structural changes is fundamental to the dynamics of its composition, evolutionary relationships between species and, in the long run, speciation. [...]
2016 - 10.1093/gbe/evw276
Genome biology and evolution, Vol. 8, issue 12 (Des. 2016) , p. 3703-3717
|
|