Web of Science: 4 cites, Scopus: 4 cites, Google Scholar: cites,
About the existence of common determinants of gene expression in the porcine liver and skeletal muscle
González Prendes, Rayner (Centre de Recerca en Agrigenòmica)
Mármol-Sánchez, Emilio (Centre de Recerca en Agrigenòmica)
Quintanilla, Raquel (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries)
Castelló Farré, Anna (Centre de Recerca en Agrigenòmica)
Zidi, Ali (Centre de Recerca en Agrigenòmica)
Ramayo-Caldas, Yuliaxis (Centre de Recerca en Agrigenòmica)
Cardoso, Tainã Figueiredo (Centre de Recerca en Agrigenòmica)
Manunza, Arianna (Centre de Recerca en Agrigenòmica)
Cánovas Tienda, Ángela (Centre de Recerca en Agrigenòmica)
Amills i Eras, Marcel (Centre de Recerca en Agrigenòmica)

Data: 2019
Resum: Background: The comparison of expression QTL (eQTL) maps obtained in different tissues is an essential step to understand how gene expression is genetically regulated in a context-dependent manner. In the current work, we have compared the transcriptomic and eQTL profiles of two porcine tissues (skeletal muscle and liver) which typically show highly divergent expression profiles, in 103 Duroc pigs genotyped with the Porcine SNP60 BeadChip (Illumina) and with available microarray-based measurements of hepatic and muscle mRNA levels. Since structural variation could have effects on gene expression, we have also investigated the co-localization of cis-eQTLs with copy number variant regions (CNVR) segregating in this Duroc population. Results: The analysis of differential expresssion revealed the existence of 1204 and 1490 probes that were overexpressed and underexpressed in the gluteus medius muscle when compared to liver, respectively (.
Ajuts: Ministerio de Economía y Competitividad AGL2013-48742-C2-1-R
Ministerio de Economía y Competitividad AGL2013-48742-C2-2-R
Ministerio de Economía y Competitividad SEV-2015-0533
Ministerio de Educación y Ciencia FPU12/00860
Ministerio de Educación y Ciencia FPU15/01733
Drets: Aquest document està subjecte a una llicència d'ús Creative Commons. Es permet la reproducció total o parcial, la distribució, la comunicació pública de l'obra i la creació d'obres derivades, fins i tot amb finalitats comercials, sempre i quan es reconegui l'autoria de l'obra original. Creative Commons
Llengua: Anglès
Document: Article ; recerca ; Versió publicada
Publicat a: BMC genomics, Vol. 20 (June 2019) , art. 518, ISSN 1471-2164

DOI: 10.1186/s12864-019-5889-5
PMID: 31234802


15 p, 2.0 MB

El registre apareix a les col·leccions:
Documents de recerca > Documents dels grups de recerca de la UAB > Centres i grups de recerca (producció científica) > Ciències > CRAG (Centre de Recerca en Agrigenòmica)
Articles > Articles de recerca
Articles > Articles publicats

 Registre creat el 2019-10-14, darrera modificació el 2022-03-27



   Favorit i Compartir