Web of Science: 0 citations, Scopus: 1 citations, Google Scholar: citations,
About the existence of common determinants of gene expression in the porcine liver and skeletal muscle
González Prendes, Rayner (Centre de Recerca en Agrigenòmica)
Mármol-Sánchez, Emilio (Centre de Recerca en Agrigenòmica)
Quintanilla Aguado, Raquel (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries)
Castelló, Anna (Centre de Recerca en Agrigenòmica)
Zidi, Ali (Centre de Recerca en Agrigenòmica)
Ramayo-Caldas, Yuliaxis (Centre de Recerca en Agrigenòmica)
Cardoso, Tainã Figueiredo (Centre de Recerca en Agrigenòmica)
Manunza, Arianna (Centre de Recerca en Agrigenòmica)
Cánovas Tienda, Ángela (Centre de Recerca en Agrigenòmica)
Amills i Eras, Marcel (Centre de Recerca en Agrigenòmica)

Date: 2019
Abstract: Background: The comparison of expression QTL (eQTL) maps obtained in different tissues is an essential step to understand how gene expression is genetically regulated in a context-dependent manner. In the current work, we have compared the transcriptomic and eQTL profiles of two porcine tissues (skeletal muscle and liver) which typically show highly divergent expression profiles, in 103 Duroc pigs genotyped with the Porcine SNP60 BeadChip (Illumina) and with available microarray-based measurements of hepatic and muscle mRNA levels. Since structural variation could have effects on gene expression, we have also investigated the co-localization of cis-eQTLs with copy number variant regions (CNVR) segregating in this Duroc population. Results: The analysis of differential expresssion revealed the existence of 1204 and 1490 probes that were overexpressed and underexpressed in the gluteus medius muscle when compared to liver, respectively (.
Note: Número d'acord de subvenció MINECO/AGL2013-48742-C2-1-R
Note: Número d'acord de subvenció MINECO/AGL2013-48742-C2-2-R
Note: Número d'acord de subvenció MINECO/SEV-2015-0533
Note: Número d'acord de subvenció MEC/FPU12/00860
Note: Número d'acord de subvenció MEC/FPU15/01733
Rights: Aquest document està subjecte a una llicència d'ús Creative Commons. Es permet la reproducció total o parcial, la distribució, la comunicació pública de l'obra i la creació d'obres derivades, fins i tot amb finalitats comercials, sempre i quan es reconegui l'autoria de l'obra original. Creative Commons
Language: Anglès.
Document: article ; recerca ; publishedVersion
Published in: BMC genomics, Vol. 20 (June 2019) , art. 518, ISSN 1471-2164

DOI: 10.1186/s12864-019-5889-5
PMID: 31234802


15 p, 2.0 MB

The record appears in these collections:
Research literature > UAB research groups literature > Research Centres and Groups (scientific output) > Experimental sciences > CRAG (Centre for Research in Agricultural Genomics)
Articles > Research articles
Articles > Published articles

 Record created 2019-10-14, last modified 2020-02-08



   Favorit i Compartir