Web of Science: 9 cites, Scopus: 9 cites, Google Scholar: cites,
Comparative analysis of tissue-specific transcriptomes in the funnel-web spider Macrothele calpeiana (Araneae, Hexathelidae)
Frías López, Cristina (Universitat de Barcelona. Departament de Biologia Animal)
Almeida, Francisca C. (Universitat de Barcelona. Departament de Biologia Animal)
Guirao-Rico, Sara (Centre de Recerca en Agrigenòmica)
Vizueta, Joel (Universitat de Barcelona. Departament de Genètica, Microbiologia i Estadística)
Sánchez-Gracia, Alejandro (Universitat de Barcelona. Departament de Genètica, Microbiologia i Estadística)
Arnedo, Miquel A. (Universitat de Barcelona. Departament de Biologia Animal)
Rozas, Julio (Universitat de Barcelona. Departament de Genètica, Microbiologia i Estadística)

Data: 2015
Resum: The funnel-web spider Macrothele calpeiana is a charismatic Mygalomorph with a great interest in basic, applied and translational research. Nevertheless, current scarcity of genomic and transcriptomic data of this species clearly limits the research in this non-model organism. To overcome this limitation, we launched the first tissue-specific enriched RNA-seq analysis in this species using a subtractive hybridization approach, with two main objectives, to characterize the specific transcriptome of the putative chemosensory appendages (palps and first pair of legs), and to provide a new set of DNA markers for further phylogenetic studies. We have characterized the set of transcripts specifically expressed in putative chemosensory tissues of this species, much of them showing features shared by chemosensory system genes. Among specific candidates, we have identified some members of the iGluR and NPC2 families. Moreover, we have demonstrated the utility of these newly generated data as molecular markers by inferring the phylogenetic position M. calpeina in the phylogenetic tree of Mygalomorphs. Our results provide novel resources for researchers interested in spider molecular biology and systematics, which can help to expand our knowledge on the evolutionary processes underlying fundamental biological questions, as species invasion or biodiversity origin and maintenance.
Nota: Altres ajuts: Beatriu de Pinós (Generalitat de Catalunya, 2010BP-A 00438 i 2010BP-B 00175)
Nota: Número d'acord de subvenció MEC/BFU2010-15484
Nota: Número d'acord de subvenció MINECO/CGL2013-45211
Nota: Número d'acord de subvenció MINECO/CGL2012-36863
Nota: Número d'acord de subvenció AGAUR/2009/SGR-1287
Nota: Número d'acord de subvenció AGAUR/2014/SGR-1055
Nota: Número d'acord de subvenció AGAUR/2014/SGR-1604
Nota: Número d'acord de subvenció MINECO/JCI-2008-3456
Drets: Aquest document està subjecte a una llicència d'ús Creative Commons. Es permet la reproducció total o parcial, la distribució, la comunicació pública de l'obra i la creació d'obres derivades, fins i tot amb finalitats comercials, sempre i quan es reconegui l'autoria de l'obra original. Creative Commons
Llengua: Anglès.
Document: article ; recerca ; publishedVersion
Matèria: Evolutionary Studies ; Genetics ; Genomics ; Zoology
Publicat a: PeerJ, Vol. 3 (June 2015) , art. e1064, ISSN 2167-8359

DOI: 10.7717/peerj.1064
PMID: 26157629


22 p, 4.8 MB

El registre apareix a les col·leccions:
Documents de recerca > Documents dels grups de recerca de la UAB > Centres i grups de recerca (producció científica) > Ciències > CRAG (Centre de Recerca en Agrigenòmica)
Articles > Articles de recerca
Articles > Articles publicats

 Registre creat el 2020-01-31, darrera modificació el 2020-03-04



   Favorit i Compartir