Análisis de redes de regulación transcripcional con Maximización de la Expectación
Toledano Gómez, Santiago
Erill, Ivan, dir. (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciències de la Computació)
Universitat Autònoma de Barcelona. Escola d'Enginyeria

Additional title:	Anàlisi de xarxes de regulació transcripcional amb Maximització de l'Expectativa
Additional title:	Analysis of transcriptional regulatory networks with Expectation Maximization
Date:	2024
Abstract:	L'objectiu d'aquest projecte és millorar l'anàlisi de les xarxes de regulació transcripcional que es duu a terme amb la plataforma CGB, mitjançant un algorisme de Maximització de l'expectativa. A partir de factors de transcripció, CGB identifica gens regulats i l'objectiu és millorar aquesta identificació. Els resultats han estat mixtos, tot i que es van detectar errors, també es van obtenir resultats prometedors amb motius ajustats a l'espècie que s'analitza, incrementant així la quantitat de gens regulats identificats. És possible que després de millorar l'algorisme es pugui utilitzar per obtenir més informació sobre la regulació dels gens amb consistència.
Abstract:	El objetivo de este Proyecto es mejorar el análisis de las redes de regulación transcripcional que se lleva a cabo con la plataforma CGB, mediante un algoritmo de Maximización de la expectación. A partir de factores de transcripción, CGB identifica genes regulados y el objetivo es mejorar esta identificación. Los resultados han sido mixtos, aunque se detectaron errores, también se obtuvieron resultados prometedores con motivos ajustados a la especie que se analiza, incrementando así la cantidad de genes regulados identificados. Es posible que tras mejorar el algoritmo se pueda utilizar para obtener más información sobre la regulación de los genes con consistencia.
Abstract:	The objective of this project is to improve the analysis of transcriptional regulatory networks carried out with the CGB platform, using an Expectation Maximization (EM) algorithm. Based on transcription factors, CGB identifies regulated genes, and the goal is to improve this identification. The results have been mixed; although errors were detected, there were also promising outcomes with motifs adjusted to the analyzed species, increasing the number of identified regulated genes. It is possible that after improving the algorithm, it can be used consistently to obtain more information on gene regulation.
Rights:	Aquest document està subjecte a una llicència d'ús Creative Commons. Es permet la reproducció total o parcial, la distribució, i la comunicació pública de l'obra, sempre que no sigui amb finalitats comercials, i sempre que es reconegui l'autoria de l'obra original. No es permet la creació d'obres derivades.
Language:	Castellà
Studies:	Enginyeria Informàtica [2502441]
Study plan:	Enginyeria Informàtica [958]
Document:	Treball final de grau ; Text
Subject area:	Menció Computació
Subject:	Xarxes de regulació transcripcional ; Maximització de l'expectativa (EM) ; Factor de transcripció (TF) ; Regulació gènica ; Motius ; Genòmica comparativa ; Bioinformàtica ; Redes de regulación transcripcional ; Maximización de la expectación (EM) ; Factor de transcripción (TF) ; Regulación génica ; Motivos ; Genómica comparativa ; Bioinformática ; Transcriptional regulatory networks ; Expectation Maximization (EM) ; Transcription factor (TF) ; Gene regulation ; Motifs ; Comparative genomics ; Bioinformatics

10 p, 645.3 KB

The record appears in these collections:
Research literature > Bachelor's degree final project > School of Engineering. TFG