Interplay between DMD Point Mutations and Splicing Signals in Dystrophinopathy Phenotypes
Juan-Mateu, Jonas (Universitat de Barcelona)
Gonzalez-Quereda, L (Institut d'Investigació Biomèdica Sant Pau)
Rodríguez, María José (Institut d'Investigació Biomèdica Sant Pau)
Verdura, Edgard (Hospital de la Santa Creu i Sant Pau (Barcelona, Catalunya))
Lázaro, Kira (Hospital de la Santa Creu i Sant Pau (Barcelona, Catalunya))
Jou, Cristina (Hospital Sant Joan de Déu (Manresa))
Nascimento, Andrés (Hospital Sant Joan de Déu (Esplugues de Llobregat, Catalunya))
Jiménez-Mallebrera, Cecilia (Hospital Sant Joan de Déu (Esplugues de Llobregat, Catalunya))
Colomer, Jaume (Hospital Sant Joan de Déu (Esplugues de Llobregat, Catalunya))
Monges, Soledad (Hospital Nacional Pediátrico Garrahan)
Lubieniecki, Fabiana (Hospital Nacional Pediátrico Garrahan)
Foncuberta, María Eugenia (Hospital Nacional Pediátrico Garrahan)
Pascual-Pascual, Samuel Ignacio (Hospital Universitario Materno Infantil La Paz)
Molano, Jesús (Hospital Universitario Materno Infantil La Paz)
Baiget Bastús, Montserrat (Hospital de la Santa Creu i Sant Pau (Barcelona, Catalunya))
Gallano, Pia (Institut d'Investigació Biomèdica Sant Pau)
Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia

Data:	2013
Resum:	DMD nonsense and frameshift mutations lead to severe Duchenne muscular dystrophy while in-frame mutations lead to milder Becker muscular dystrophy. Exceptions are found in 10% of cases and the production of alternatively spliced transcripts is considered a key modifier of disease severity. Several exonic mutations have been shown to induce exon-skipping, while splice site mutations result in exon-skipping or activation of cryptic splice sites. However, factors determining the splicing pathway are still unclear. Point mutations provide valuable information regarding the regulation of pre-mRNA splicing and elements defining exon identity in the DMD gene. Here we provide a comprehensive analysis of 98 point mutations related to clinical phenotype and their effect on muscle mRNA and dystrophin expression. Aberrant splicing was found in 27 mutations due to alteration of splice sites or splicing regulatory elements. Bioinformatics analysis was performed to test the ability of the available algorithms to predict consequences on mRNA and to investigate the major factors that determine the splicing pathway in mutations affecting splicing signals. Our findings suggest that the splicing pathway is highly dependent on the interplay between splice site strength and density of regulatory elements. © 2013 Juan-Mateu et al.
Drets:	Aquest material està protegit per drets d'autor i/o drets afins. Podeu utilitzar aquest material en funció del que permet la legislació de drets d'autor i drets afins d'aplicació al vostre cas. Per a d'altres usos heu d'obtenir permís del(s) titular(s) de drets.
Llengua:	Anglès
Document:	Article ; recerca ; Versió publicada
Publicat a:	PloS one, Vol. 8 Núm. 3 (25 2013) , p. e59916, ISSN 1932-6203

DOI: 10.1371/journal.pone.0059916
PMID: 23536893

15 p, 7.6 MB

El registre apareix a les col·leccions:
Documents de recerca > Documents dels grups de recerca de la UAB > Centres i grups de recerca (producció científica) > Ciències de la salut i biociències > Institut de Recerca Sant Pau
Articles > Articles de recerca
Articles > Articles publicats