Analysis of the conservation of structural elements in biological sequences
García Suárez, Pedro
Serra Sagristà, Joan, dir. (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Enginyeria de la Informació i de les Comunicacions)
Universitat Autònoma de Barcelona. Escola d'Enginyeria

Additional title:	Anàlisi de la conservació d'elements estructurals en seqüències biològiques
Additional title:	Análisis de la conservación de elementos estructurales en sequencias biológicas
Date:	2021
Abstract:	The project executed for this TFG is the study of the DNA in Mobile Genetic Elements (MGEs). These entities consist of encapsulated genetic material that can insert itself in a live organism. Generally, MGEs take advantage of certain mechanisms of the host and the goal of this study is to find patterns that may indicate this type of behaviour, specifically the mechanisms that regulate the transcription of DNA. This will be achieved by comparing the DNA of hundreds of MGEs with the sequences of proteins that are synthesized by the organisms infected. The matches found will be contextualized using control cases to extract the maximum amount of useful information about them. This analysis will be implemented by different scripts written in Python.
Abstract:	El projecte realitzat per a aquest TFG és l'estudi de l'ADN d'Elements Genètics Móbiles o MGEs de les seves sigles en anglès (Mobile Genetic Elements). Aquestes entitats consisteixen en material genètic encapsulat que és capaç d'inserir-se dins d'organismes vius. Els MGEs generalment s'aprofiten d'uns certs mecanismes de l'organisme al qual envaeixen i la finalitat d'aquest estudi és trobar patrons que puguin indicar un comportament d'aquest tipus, en concret en els mecanismes de regulació de la transcripció de l'ADN. Això s'aconseguirà comparant l'ADN de centenars de MGEs amb les seqüències de proteïnes que se sintetitzen en els organismes que aquests infecten. Les coincidències que es trobin seran contextualitzades utilitzant casos de control per a extreure el màxim d'informació útil possible d'elles. L'anàlisi es realitzarà mitjançant diversos scripts en llenguatge Python.
Abstract:	El proyecto realizado para este TFG es el estudio del ADN de Elementos Genéticos Móbiles o MGEs de sus siglas en inglés (Mobile Genetic Elements). Estas entidades consisten en material genético encapsulado que es capaz de insertarse dentro de organismos vivos. Los MGEs generalmente se aprovechan de ciertos mecanismos del organismo al que invaden y la finalidad de este estudio es hallar patrones que puedan indicar un comportamiento de este tipo, en concreto en los mecanismos de regulación de la transcripción del ADN. Esto se logrará comparando el ADN de cientos de MGEs con las secuencias de proteínas que se sintetizan en los organismos que estos infectan. Las coincidencias que se encuentren serán contextualizadas utilizando casos de control para extraer el máximo de información útil posible de ellas. El análisis se realizará mediante varios scripts en lenguaje Python.
Rights:	Aquest document està subjecte a una llicència d'ús Creative Commons. Es permet la reproducció total o parcial, la distribució, la comunicació pública de l'obra i la creació d'obres derivades, fins i tot amb finalitats comercials, sempre i quan es reconegui l'autoria de l'obra original.
Language:	Anglès
Studies:	Grau en Enginyeria Informàtica [2502441]
Study plan:	Enginyeria Informàtica [958]
Document:	Treball final de grau ; Text
Subject area:	Menció Tecnologies de la Informació
Subject:	Bioinformatics ; Bioinformàtica ; Bioinformática ; MGEs ; Python ; BioPython ; Proteins ; Proteïnes ; Proteínas ; Motifs ; Motius ; Motivos ; Promoting Regions ; Regions Promotores ; Regiones Promotoras ; Transcription Factors ; Factors de Transcripció ; Factores de Transcripción

7 p, 565.3 KB

The record appears in these collections:
Research literature > Bachelor's degree final project > School of Engineering. TFG