Articles

Articles 45 records found  previous11 - 20nextend  jump to record: Search took 0.01 seconds. 
11.
17 p, 5.2 MB A global analysis of CNVs in swine using whole genome sequence data and association analysis with fatty acid composition and growth traits / Revilla Sánchez, Manuel (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Puig-Oliveras, Anna (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments) ; Castelló Farré, Anna (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Crespo-Piazuelo, Daniel (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Paludo, Ediane (Santa Catarina State University. Department of Animal Science) ; Fernández, Ana I. (Instituto Nacional de Investigación y Tecnología Agraria y Alimentaria (Espanya). Departamento de Mejora Genética Animal) ; Ballester Devis, Maria (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries. Departament de Genètica i Millora Animal) ; Folch, Josep M. (Centre de Recerca en Agrigenòmica)
Copy number variations (CNVs) are important genetic variants complementary to SNPs, and can be considered as biomarkers for some economically important traits in domestic animals. In the present study, a genomic analysis of porcine CNVs based on next-generation sequencing data was carried out to identify CNVs segregating in an Iberian x Landrace backcross population and study their association with fatty acid composition and growth-related traits. [...]
2017 - 10.1371/journal.pone.017701
PloS one, Vol. 12, Num. 5 (May 2017) , art. e0177014  
12.
13 p, 667.1 KB Expression analysis of porcine miR-33a/b in liver, adipose tissue and muscle and its potential role in fatty acid metabolism / Criado Mesas, Lourdes (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Ballester Devis, Maria (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries. Departament de Genètica i Millora Animal) ; Crespo-Piazuelo, Daniel (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Passols Manzano, Magí (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Castelló Farré, Anna (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments) ; Sánchez Bonastre, Armando (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments) ; Folch, Josep M. (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments)
mir-33a and mir-33b are co-transcribed with the SREBF2 and SREBF1 transcription factors, respectively. The main role of SREBF1 is the regulation of genes involved in fatty acid metabolism, while SREBF2 regulates genes participating in cholesterol biosynthesis and uptake. [...]
2021 - 10.1371/journal.pone.0245858
PloS one, Vol. 16, Num. 1 (January 2021) , art. e0245858  
13.
11 p, 1.0 MB Detecting the footprint of selection on the genomes of Murciano-Granadina goats / Guan, Dailu (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Martinez, Amparo (Universidad de Córdoba. Departamento de Genética) ; Luigi Sierra, Maria Gracia (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Delgado Bermejo, Juan Vicente (Universidad de Córdoba. Departamento de Genética) ; Landi, Vincenzo (University of Bari "Aldo Moro") ; Castelló Farré, Anna (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Fernández Álvarez, Javier (Asociación Nacional de Criadores de Caprino de Raza Murciano-Granadina) ; Such i Martí, Francesc Xavier (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments) ; Jordana i Vidal, Jordi (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments) ; Amills i Eras, Marcel (Centre de Recerca en Agrigenòmica)
Artificial selection is one of the major forces modifying the genetic composition of livestock populations. Identifying genes under selection could be useful to elucidate their impact on phenotypic variation. [...]
2021 - 10.1111/age.13113
Animal Genetics  
14.
55 p, 2.5 MB A genome-wide association analysis for body, udder, and leg conformation traits recorded in Murciano-Granadina goats / Luigi Sierra, Maria Gracia (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Landi, Vincenzo (University of Bari "Aldo Moro") ; Guan, Dailu (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Delgado Bermejo, Juan Vicente (Universidad de Córdoba. Departamento de Genética) ; Castelló Farré, Anna (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Cabrera Pane, Betlem (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Mármol-Sánchez, Emilio (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Fernández Álvarez, Javier (Asociación Nacional de Criadores de Caprino de Raza Murciano-Granadina) ; Gómez-Carpio, Mayra (Universidad de Córdoba. Departamento de Genética) ; Martinez, Amparo (Universidad de Córdoba. Departamento de Genética) ; Such i Martí, Francesc Xavier (Universitat Autònoma de Barcelona. Grup de Recerca en Remugants (G2R)) ; Jordana i Vidal, Jordi (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments) ; Amills i Eras, Marcel (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments)
Morphological traits are of great importance to dairy goat production given their effect on phenotypes of economic interest. However, their underlying genomic architecture has not yet been extensively characterized. [...]
2020 - 10.3168/jds.2020-18461
Journal of dairy science, Vol. 103, Issue 12 (December 2020) , p. 11605-11617
2 documents
15.
25 p, 927.2 KB Estimating the copy number of the agouti signaling protein (ASIP) gene in goat breeds with different color patterns / Guan, Dailu (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Castelló Farré, Anna (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments) ; Luigi Sierra, Maria Gracia (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Landi, Vincenzo (University of Bari "Aldo Moro") ; Delgado Bermejo, Juan Vicente (Universidad de Córdoba. Departamento de Genética) ; Martinez, Amparo (Universidad de Córdoba. Departamento de Genética) ; Amills i Eras, Marcel (Centre de Recerca en Agrigenòmica)
The agouti signaling protein (ASIP) gene has a crucial role in pigmentation by encoding a protein that binds the melanocortin 1 receptor and stimulates the synthesis of pheomelanin rather than eumelanin. [...]
2021 - 10.1016/j.livsci.2021.104440
Livestock Science, Vol. 246 (April 2021) , art. 104440  
16.
19 p, 1.5 MB Analyzing the genomic and transcriptomic architecture of milk traits in Murciano-Granadina goats / Guan, Dailu (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Landi, Vincenzo (Universidad de Córdoba. Departamento de Genética) ; Luigi Sierra, Maria Gracia (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Delgado Bermejo, Juan Vicente (Universidad de Córdoba. Departamento de Genética) ; Such i Martí, Francesc Xavier (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments) ; Castelló Farré, Anna (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Cabrera Pane, Betlem (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Mármol-Sánchez, Emilio (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Fernández Álvarez, Javier (Asociación Nacional de Criadores de Caprino de Raza Murciano-Granadina) ; De La Torre Casañas, José Luis (Universitat Autònoma de Barcelona. Servei de Granges i Camps Experimentals) ; Martinez, Amparo (Universidad de Córdoba. Departamento de Genética) ; Jordana i Vidal, Jordi (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments) ; Amills i Eras, Marcel (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments)
Background:In this study, we aimed to investigate the molecular basis of lactation as well as to identify the genetic factors that influence milk yield and composition in goats. To achieve these two goals, we have analyzed how the mRNA profile of the mammary gland changes in seven Murciano-Granadina goats at each of three different time points, i. [...]
2020 - 10.1186/s40104-020-00435-4
Journal of animal science and biotechnology, Vol. 11 (March 2020) , art. 35  
17.
21 p, 2.5 MB A systems biology framework integrating GWAS and RNA-seq to shed light on the molecular basis of sperm quality in swine / Gòdia, Marta (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Reverter, Antonio (Queensland Bioscience Precinct. CSIRO Agriculture and Food (Australia)) ; González Prendes, Rayner (Wageningen University & Research. Animal Breeding and Genomics (The Netherlands)) ; Ramayo-Caldas, Yuliaxis (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries. Departament de Genètica i Millora Animal) ; Castelló Farré, Anna (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Rodríguez Gil, Joan Enric (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Medicina i Cirurgia Animals) ; Sánchez Bonastre, Armando (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments) ; Clop, Alex (Centre de Recerca en Agrigenòmica)
Background: Genetic pressure in animal breeding is sparking the interest of breeders for selecting elite boars with higher sperm quality to optimize ejaculate doses and fertility rates. However, the molecular basis of sperm quality is not yet fully understood. [...]
2020 - 10.1186/s12711-020-00592-0
Genetics, selection, evolution, Vol. 52 (December 2020) , art. 72  
18.
17 p, 2.7 MB Identification of strong candidate genes for backfat and intramuscular fatty acid composition in three crosses based on the Iberian pig / Crespo-Piazuelo, Daniel (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Criado Mesas, Lourdes (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Revilla Sánchez, Manuel (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Castelló Farré, Anna (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Noguera, José Luis (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries. Departament de Genètica i Millora Animal) ; Fernández, Ana I. (Instituto Nacional de Investigación y Tecnología Agraria y Alimentaria (Espanya). Departamento de Mejora Genética Animal) ; Ballester Devis, Maria (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries. Departament de Genètica i Millora Animal) ; Folch, Josep M. (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments
Meat quality has an important genetic component and can be modified by the fatty acid (FA) composition and the amount of fat contained in adipose tissue and muscle. The present study aimed to find genomic regions associated with the FA composition in backfat and muscle (longissimus dorsi) in 439 pigs with three different genetic backgrounds but having the Iberian breed in common. [...]
2020 - 10.1038/s41598-020-70894-2
Scientific reports, Vol. 10 (August 2020) , art. 13962  
19.
13 p, 2.2 MB Identification of eQTLs associated with lipid metabolism in Longissimus dorsi muscle of pigs with different genetic backgrounds / Criado Mesas, Lourdes (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Ballester Devis, Maria (Institut de Biologie Structurale. Laboratoire de Cristallographie Macromoléculaire) ; Crespo-Piazuelo, Daniel (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Castelló Farré, Anna (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Fernández Ávila, Ana Isabel (Instituto Nacional de Investigación y Tecnología Agraria y Alimentaria (Espanya). Departamento de Mejora Genética Animal) ; Folch, Josep M. (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments
Intramuscular fat content and its fatty acid composition affect porcine meat quality and its nutritional value. The present work aimed to identify genomic variants regulating the expression in the porcine muscle (Longissimus dorsi) of 45 candidate genes for lipid metabolism and fatty acid composition in three experimental backcrosses based on the Iberian breed. [...]
2020 - 10.1038/s41598-020-67015-4
Scientific reports, Vol. 10 (June 2020) , art. 9845  
20.
10 p, 1.3 MB A genome-wide analysis of copy number variation in Murciano-Granadina goats / Guan, Dailu (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Martinez, Amparo (Universidad de Córdoba. Departamento de Genética) ; Castelló Farré, Anna (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Landi, Vincenzo (Universidad de Córdoba. Departamento de Genética) ; Luigi Sierra, Maria Gracia (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Fernández Álvarez, Javier (Asociación Nacional de Criadores de Caprino de Raza Murciano-Granadina) ; Cabrera Pane, Betlem (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Delgado Bermejo, Juan Vicente (Universidad de Córdoba. Departamento de Genética) ; Such i Martí, Francesc Xavier (Universitat Autònoma de Barcelona. Grup de Recerca en Remugants (G2R)) ; Jordana i Vidal, Jordi (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments) ; Amills i Eras, Marcel (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments
Background: In this work, our aim was to generate a map of the copy number variations (CNV) segregating in a population of Murciano-Granadina goats, the most important dairy breed in Spain, and to ascertain the main biological functions of the genes that map to copy number variable regions. [...]
2020 - 10.1186/s12711-020-00564-4
Genetics, selection, evolution, Vol. 52 (August 2020) , art. 44  

Articles : 45 records found   previous11 - 20nextend  jump to record:
Interested in being notified about new results for this query?
Set up a personal email alert or subscribe to the RSS feed.