|
26.
|
|
15 p, 3.0 MB |
Single-cell transcriptome conservation in cryopreserved cells and tissues
/
Guillaumet-Adkins, Amy (Centre de Regulació Genòmica) ;
Rodríguez-Esteban, Gustavo (Centre de Regulació Genòmica) ;
Mereu, Elisabetta (Centre de Regulació Genòmica) ;
Mendez-Lago, Maria (Centre de Regulació Genòmica) ;
Jaitin, Diego A. (Weizmann Institute of Science (Israel). Department of Immunology) ;
Villanueva, Alberto (Hospital Universitari de Bellvitge) ;
Vidal, August (Institut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge) ;
Martinez-Marti, Alex (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Medicina) ;
Felip, Enriqueta (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Medicina) ;
Vivancos, Ana (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Keren-Shaul, Hadas (Weizmann Institute of Science (Israel). Department of Immunology) ;
Heath, Simon (Centre de Regulació Genòmica) ;
Gut, Marta (Centre de Regulació Genòmica) ;
Amit, Ido (Weizmann Institute of Science (Israel). Department of Immunology) ;
Gut, Ivo (Centre de Regulació Genòmica) ;
Heyn, Holger (Centre de Regulació Genòmica)
A variety of single-cell RNA preparation procedures have been described. So far, protocols require fresh material, which hinders complex study designs. We describe a sample preservation method that maintains transcripts in viable single cells, allowing one to disconnect time and place of sampling from subsequent processing steps. [...]
2017 -  10.1186/s13059-017-1171-9
Genome biology, Vol. 18 (march 2017)
|
|
|
27.
|
|
15 p, 962.2 KB |
Mammalian comparative genomics reveals genetic and epigenetic features associated with genome reshuffling in Rodentia
/
Capilla Pérez, Laia (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Biologia Animal, de Biologia Vegetal i d'Ecologia) ;
Sánchez-Guillén, Rosa Ana (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ;
Farré, Marta (Instituto de Ecología A.C (Mèxic)) ;
Paytuví-Gallart, Andreu (Sequentia Biotech S.L.) ;
Malinverni, Roberto (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Biologia Cel·lular, de Fisiologia i d'Immunologia) ;
Ventura Queija, Jacinto (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Biologia Animal, de Biologia Vegetal i d'Ecologia) ;
Larkin, Denis M. (Instituto de Ecología A.C (Mèxic)) ;
Ruiz-Herrera Moreno, Aurora (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí")
Understanding how mammalian genomes have been reshuffled through structural changes is fundamental to the dynamics of its composition, evolutionary relationships between species and, in the long run, speciation. [...]
2016 - 10.1093/gbe/evw276
Genome biology and evolution, Vol. 8, issue 12 (Des. 2016) , p. 3703-3717
|
|
|
28.
|
|
18 p, 3.4 MB |
Genome and transcriptome analysis of the Mesoamerican common bean and the role of gene duplications in establishing tissue and temporal specialization of genes
/
Vlasova, Anna (Centre de Regulació Genòmica) ;
Capella-Gutiérrez, Salvador (Centre de Regulació Genòmica) ;
Rendón-Anaya, Martha (Laboratorio Nacional de Genómica para la Biodiversidad) ;
Hernández-Oñate, Miguel (Laboratorio Nacional de Genómica para la Biodiversidad) ;
Minoche, André E. (Garvan Institute of Medical Research (Darlinghurst, Austràlia)) ;
Erb, Ionas (Centre de Regulació Genòmica) ;
Câmara, Francisco (Centre de Regulació Genòmica) ;
Prieto-Barja, Pablo (Centre de Regulació Genòmica) ;
Corvelo, André (New York Genome Center) ;
Sanseverino, Walter (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Westergaard, Gastón (Instituto de Agrobiotecnología Rosario) ;
Dohm, Juliane C. (Universität für Bodenkultur) ;
Pappas, Georgios J. (Universidade de Brasília. Departamento de Biologia Celular) ;
Saburido-Alvarez, Soledad (Laboratorio Nacional de Genómica para la Biodiversidad) ;
Kedra, Darek (Centre de Regulació Genòmica) ;
Gonzalez, Irene (Universitat Pompeu Fabra) ;
Cozzuto, Luca (Centre de Regulació Genòmica) ;
Gómez-Garrido, Jessica (Universitat Pompeu Fabra) ;
Aguilar-Morón, María A. (Universitat Pompeu Fabra) ;
Andreu, Nuria (Universitat Pompeu Fabra) ;
Aguilar, O. Mario (Universidad Nacional de La Plata. Instituto de Biotecnología y Biología Molecular) ;
Garcia-Mas, Jordi (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Zehnsdorf, Maik (Universitat Pompeu Fabra) ;
Vázquez, Martín P. (Instituto de Agrobiotecnología Rosario) ;
Delgado-Salinas, Alfonso (Universidad Nacional Autónoma de México. Departamento de Botánica) ;
Delaye, Luis (Centro de Investigación y de Estudios Avanzados del I.P.N. Unidad Irapuato. Departamento de Ingeniería Genética) ;
Lowy, Ernesto (European Bioinformatics Institute) ;
Mentaberry, Alejandro (Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales) ;
Vianello-Brondani, Rosana P. (Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária) ;
García, José Luis (Centro Superior de Investigaciones Científicas. Departamento de Biología Ambiental) ;
Alioto, Tyler Scott (Centre de Regulació Genòmica) ;
Sánchez, Federico (Universidad Nacional Autónoma de México. Departamento de Biología Molecular de Plantas) ;
Himmelbauer, Heinz (Universität für Bodenkultur) ;
Santalla, Marta (Centro Superior de Investigaciones Científicas. Mision Biológica de Galicia) ;
Notredame, Cedric (Universitat Pompeu Fabra) ;
Gabaldón, Toni (Institució Catalana de Recerca i Estudis Avançats) ;
Herrera-Estrella, Alfredo (centro de Investigación y de Estudios Avanzados del I.P.N. Unidad Irapuato. Laboratorio Nacional de Genómica para la Biodiversidad) ;
Guigó, Roderic (Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques)
Legumes are the third largest family of angiosperms and the second most important crop class. Legume genomes have been shaped by extensive large-scale gene duplications, including an approximately 58 million year old whole genome duplication shared by most crop legumes. [...]
2016 - 10.1186/s13059-016-0883-6
Genome biology, Vol. 17 (2016) , art. 32
|
|
|
29.
|
|
10 p, 479.1 KB |
Contrasting Genomic Diversity in Two Closely Related Postharvest Pathogens : Penicillium digitatum and Penicillium expansum
/
Julca, Irene (Centre de Regulació Genòmica) ;
Droby, Samir (Department of Postharvest Science. ARO. The Volcani Center. Israel) ;
Sela, Noa (Department of Plant Pathology and Weed Research. The Volcani Center. Israel) ;
Marcet-Houben, Marina (Universitat Pompeu Fabra) ;
Gabaldón, Toni (Institució Catalana de Recerca i Estudis Avançats) ;
Universitat Autònoma de Barcelona
Penicillium digitatum and Penicillium expansum are two closely related fungal plant pathogens causing green and blue mold in harvested fruit, respectively. The two species differ in their host specificity, being P. [...]
2016 - 10.1093/gbe/evv252
Genome biology and evolution, Vol. 8, Núm 1 (January 2016) , p. 218-227
|
|
|
30.
|
|
14 p, 654.2 KB |
Recent Positive Selection Has Acted on Genes Encoding Proteins with More Interactions within the Whole Human Interactome
/
Luisi, Pierre (Institut de Biologia Evolutiva (UPF-CSIC) (Barcelona)) ;
Alvarez-Ponce, David (Institut de Biologia Evolutiva (UPF-CSIC) (Barcelona)) ;
Pybus, Marc (Institut de Biologia Evolutiva (UPF-CSIC) (Barcelona)) ;
Fares, Mario A. (University of Dublin. Smurfit Institute of Genetics) ;
Bertranpetit, Jaume (Institut de Biologia Evolutiva (UPF-CSIC) (Barcelona)) ;
Laayouni, Hafid (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia)
Genes vary in their likelihood to undergo adaptive evolution. The genomic factors that determine adaptability, however, remain poorly understood. Genes function in the context of molecular networks, with some occupying more important positions than others and thus being likely to be under stronger selective pressures. [...]
2015 - 10.1093/gbe/evv055
Genome biology and evolution, Vol. 7, issue 4 (april 2015) , p. 1141-1154
|
|
|
31.
|
|
12 p, 676.9 KB |
Tetris Is a Foldback Transposon that Provided the Building Blocks for an Emerging Satellite DNA of Drosophila virilis
/
Dias, Guilherme B. (Universidade Federal de Minas Gerais. Departamento de Biologia Geral) ;
Svartman, Marta (Universidade Federal de Minas Gerais. Departamento de Biologia Geral) ;
Delprat Obeaga, Alejandra (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia) ;
Ruiz, Alfredo (Ruiz Panadero) (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia) ;
Kuhn, Gustavo C. S. (Universidade Federal de Minas Gerais. Departamento de Biologia Geral)
Transposable elements (TEs) and satellite DNAs (satDNAs) are abundant components of most eukaryotic genomes studied so far and their impact on evolution has been the focus of several studies. A number of studies linked TEs with satDNAs, but the nature of their evolutionary relationships remains unclear. [...]
2014 - 10.1093/gbe/evu108
Genome biology and evolution, Vol. 6, Issue 6 (june 2014) , p. 1302-1313
|
|
|
32.
|
|
15 p, 532.3 KB |
A Divergent P Element and Its Associated MITE, BuT5, Generate Chromosomal Inversions and Are Widespread within the Drosophila repleta Species Group
/
Rius, Nuria (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia) ;
Delprat Obeaga, Alejandra (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia) ;
Ruiz, Alfredo (Ruiz Panadero) (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia)
The transposon BuT5 caused two chromosomal inversions fixed in two Drosophila species of the repleta group, D. mojavensis and D. uniseta. BuT5 copies are approximately 1-kb long, lack any coding capacity, and do not resemble any other transposable element (TE). [...]
2013 - 10.1093/gbe/evt076
Genome biology and evolution, Vol. 5 (may 2013) , p. 1127-1141
|
|
|
33.
|
|
|
34.
|
|
|
35.
|
|
6 p, 300.2 KB |
Drosophila females undergo genome expansion after interspecific hybridization
/
Romero-Soriano, Valèria (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia) ;
Burlet, Nelly (Université de Lyon. Laboratoire de Biométrie et Biologie evolutive) ;
Vela, Doris (Pontificia Universidad Católica del Ecuador. Laboratorio de Genética Evolutiva.) ;
Fontdevila, Antonio (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia) ;
Vieira, Cristina (Université de Lyon. Laboratoire de Biométrie et Biologie evolutive) ;
García Guerreiro, María Pilar (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia)
Genome size (or C-value) can present a wide range of values among eukaryotes. This variation has been attributed to differences in the amplification and deletion of different noncoding repetitive sequences, particularly transposable elements (TEs). [...]
2016 - 10.1093/gbe/evw024
Genome biology and evolution, Vol.8, Issue 3 (March 2016) , p. 556-561
|
|
visitant ::
identificació
alerta personal via correu electrònic o subscribiu-vos al 
canal RSS.
